環保署在3月中已宣布，呼籲民眾改變上廁所習慣「如廁後將衛生紙丟入馬桶」，預計6月正式實施，不少單位也已配合，台北捷運日前(27日)也宣布「可以放心將如廁衛生紙丟入馬桶沖掉。」，但因為相關配套作業準備不及，環署已發公文改為6月30日前要完成公廁張貼「衛生紙請丟馬桶」圖示，從7月起將加強公廁環境衛生稽查及不定期抽查。
許多機關張貼「不溶於水，禁止投入馬桶」標語
衛生紙丟馬桶，下月上路，但各地陸續傳出擔心公廁馬桶會阻塞，主張維持丟垃圾桶。包括汙水下水道普及率最高的台北市，傳出半數以上的公廁馬桶容易阻塞，其他像台南市也傳出擔心阻塞問題。至今很多公家單位都未配合，甚至台北市聯合醫院中醫院區在廁間還張貼標語「本廁所使用之衛生紙為環保製品，不溶於水，禁止投入馬桶」，多數公廁外販賣機所售的仍是較不溶於水的面紙。
對此，環保署解釋，衛生紙重量占糞便比只有約百分之三點四到百分之十四點三，在汙水道轉化成汙泥量的比率也低，且有些糞便十分乾硬，都未造成阻塞問題，強調只要馬桶與排水管平時無糞便堵塞，丟入衛生紙就不會造成阻塞。
環保署:衛生紙屬於短纖維，絕對可溶於水
環保署也說，衛生紙都屬於短纖維，絕對可溶於水，沒有什麼「環保製品不溶於水」的謬論，會請各地方政府加強稽查，現況馬桶恐會堵塞的，就要標示是「因為會堵塞」，不要出現誤導民眾情況。
環署環管處簡任技正邱國書說，不論能不能丟馬桶，公廁廁間都必須清楚標示，同時要求各地方政府在10月底前，將全部廁間的標示拍回，以做控管，短期仍請公廁要標示「馬桶易堵塞，衛生紙勿丟馬桶」，但長期應規劃編列經費修繕或汰換老舊設備及管線，使其未來能達到衛生紙丟馬桶之條件，以提升我國公廁環境品質。
環保署表示，6月底前公廁要貼出衛生紙請丟馬桶的標語，但如果沒辦法，可以貼出「馬桶易阻塞，衛生紙請丟垃圾桶」等標語，對此外界質疑，恐有不少公廁怕麻煩，乾脆全貼「馬桶易阻塞，衛生紙請丟垃圾桶」，不僅更難翻轉民眾習慣，也影響到政策推展。不過環保署說，了解一時國人要改變不易，但會慢慢引導。
