日前健保署公告健保差額給付新制，引發醫界人士反彈，有媒體指稱行政院長蘇貞昌藉新制一事教訓衛福部，並批評衛福部長陳時中。對此，陳時中16日受訪時表示沒有此事，強調在行政體制及行政倫理上，本來就是行政院長說了算，對於醫材新制的後續處理，也提出3大面向，承諾將與醫界、民眾討論。
健保差額給付新制規定民眾自付差額上限，引發醫界擔心價格較高但品質好的醫材恐退出台灣，造成反彈強烈。
外傳蘇貞昌曾就此事「教訓」陳時中，不過陳時中出席立法院「國際旅遊聯盟」座談會後受訪時回應「沒有、沒有」，並強調在整個行政體制、行政倫理上，本就是行政院長說了算。
陳時中：已責成健保署，希望回歸尊重專業自主
陳時中表示，蘇貞昌一向勉勵閣員在施政上要更宏觀，自己已責成健保署，希望回歸尊重專業自主、資訊透明公開、對極端異常狀況做異常管理，以這3點與相關監督單位討論，研究政策能否更符合民意，以及醫界、消費者的需求，並促進醫病關係。
對於總統蔡英文跟蘇貞昌前往九份拚觀光，媒體追問陳時中，是否會覺得自己被「丟包」了，陳時中回應，每個人有每個人需要做的事情，自己16日早到紡研所看口罩，因為這不管是對於研發、調度物資及戰情上，都有很大的幫助，中午參加座談會後，下午還要開中央流行疫情指揮中心的會議，強調每一個人都有職責所在，自己應先把這塊做好。
