端午連假為25至28日共4日，將是「防疫新生活」啟動後面臨的首波連假，交通部長林佳龍於17日召開端午疏運會議，並指示各局處以旅客角度出發，強化各運具之間的整合，例如針對高鐵無自由座所減少的運能，應事先備妥客運或台鐵等運具的運能，並主動引導旅客在時間及運具上分流。
根據交通部端午疏運計畫的預估，今年端午連假受新冠肺炎（武漢肺炎）疫情與「反彈式出遊」影響，加上過去端午節通常在於學生期末考前，家庭出遊情況較少，連帶使觀光帶動的人車移動，相較於春節、清明節等假期少，然而，今年暑假往後延兩周，這也導致出遊人車潮較難估計。
林佳龍會中指出，各單位應加強橫向聯繫，並於連假前再由次長主持疏運會議，確認各單位疏運計畫皆能順利執行，他將親自前往視察疏運狀況。此外，高鐵採全車對號座，可能會有民眾買不到票，各單位間應強化橫向聯繫，疏導無法搭乘高鐵的民眾改搭台鐵或客運返家。
連假期間不售自由座 高鐵籲民眾分流乘車
由於防疫因素，高鐵於連假期間仍不販售自由座，致使列車的座位數固定，無法如過去能用加開「全車自由座」方式疏運旅客，因此，雖高鐵已增開215班列車營運，並將現有34組列車中的33組上線服務旅客，但也逼近運能的極致，未來再加開班次空間有限。
高公局估計，6月25日端午節當日，國道南下將會湧入較平常1.6倍的車潮，而國五南下的車潮更將是平時的1.8倍，建議民眾可以改駛台61線。假期第1、2日南下建議於下午1點後出發，第3、4日北上建議上午12點以前出發，並善用「1968」APP掌握最即時的路況，避免壅塞。
而公路總局也為因應蘇花改可能湧現小客車車流，因此於連假期間的特定時段，管制大貨車單向或雙向通行，同時提升蘇花改主線路段行車速限提升至70公里。高公局、公總也建議前往東部的民眾，可以多搭乘公共運輸，且因國道5號提供大客車優先通行，公共運輸單程可能較自駕省30分鐘以上。
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