導演齊柏林在為《看見台灣Ⅱ》取景時，意外墜機身亡，引發社會關注，前總統馬英九也對此表示，「非常沉痛、非常難過」，認為齊柏林就像是一隻啄木鳥一樣，把害蟲找出來，非常了不起，但卻沒想到他會因為自己最愛的事物而喪失性命。
「沒有人想到他會在這時候離開我們。」馬英九於11日出席世新大學畢業典禮，在致詞時提到齊柏林發生空難，馬英九回憶，他跟齊柏林很熟，還曾請齊柏林參與總統府的治國週記。他認為，齊柏林付出他的生命，讓我們看到自己的錦繡河山受到如此的破壞，是非常了不起的事。
「真的非常沉痛、非常難過」，馬英九表示，自己在到達世新大學前，還在看齊的影片，甚至一度掉淚，沒想到他會在這時候離開。他表示，齊柏林記錄下的台灣影像，讓有些污染慢慢在改善，有的工程停止，有的傷痕在復原，這些「絕對比他不做好很多」。
馬英九認為政府應該好好褒揚他，讓大家重視他所關心的台灣，而雖然他不清楚齊柏林有無培養接班人，但卻希望有人能接續齊柏林所做，繼續讓大眾「看見台灣」。
