中央流行疫情指揮中心17日公布1名美返台少年確診，但該案例是居家隔離期間，在無症狀的情況下被主動採檢，做法不符中央現行政策，指揮中心18日下令政風處徹查，引發輿論兩極熱議。對此，指揮官陳時中20日坦言是「疫情以來最嚴重爭議」，但強調政風能調查行政違常，且與他們屬於不同體系，因此公正性會較好。
陳時中今天在《周玉蔻嗆新聞》上表示，指揮中心有必要掌握所有狀況，否則就無法做出最正確的判斷，政風介入則是因為與程序不符；至於爭議關鍵「為何是政風處調查？」陳時中直言，政風處有點被污名化了，政風自己是一條鞭，與他們是屬於不同單位，跟他們沒有直接關係，而政風不懂防疫更能從法律面好好查出證據，最快5天內就能調查出結果。
陳時中表示，居家檢疫者不可外出，但既然該案檢疫中且無症狀，為何會前往就醫？這就是本案不明之處，也因此啟動政風調查。且當防疫單位詢問時，對方還一度表示「病人回憶2天前有咳嗽」，這句話是蠻嚴重的，因為先前疫調卻聲稱無症狀，程序有問題才改口可能有症狀，這樣下去沒完沒了。
至於彰縣衛生局長葉彥伯主張，疫調採檢應屬於地方權責，陳時中則表示，當中央開設流行疫情指揮中心時，尤其是已經成為一級單位後，就應該遵守中央下令進行，而彰化要主動採檢並無不可，但是應該先行報告，若指揮中心成立以後卻出現中央不知情的狀況，將來防疫恐怕會有問題。
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