不論他在立陶宛首都維爾紐斯屠殺中扮演了什麼角色，結果都傷到了他。立陶宛的民族主義呼聲大漲。這3個自己宣布獨立的國家已把俄羅斯當成是外國，而葉爾欽在愛沙尼亞首都塔林承認了3國的地位。葉爾欽以俄羅斯最高蘇維埃主席的身分譴責了維爾紐斯大屠殺。俄國民主運動人士也在莫斯科示威抗議軍事暴力。
戈巴契夫沒有讓葉爾欽在1987年秋退出政壇後永遠回不來，現在他要面對這個對手。葉爾欽呼籲要採取更激進的政治經濟政策，他也樂見波羅的海國家獨立出去。
戈巴契夫的國際地位也在下滑。2月25日，在有蘇聯、保加利亞、匈牙利、波蘭、捷克斯洛伐克和羅馬尼亞等國外長和國防部長出席的布加勒斯特會議中，華沙公約組織宣布解散。「經濟互助委員會」也在幾個月後壽終正寢。
戈巴契夫不得不接受不可避免的結果：東歐國家根本不想和蘇聯在軍事或經濟上同盟。他們只想加強他們剛從莫斯科掙脫後的自由。
3月17日，蘇聯領導人舉辦是否維持蘇聯的公民投票，希望能強化自己的地位。多數共和國都是贊成票占多數。英國外長道格拉斯．赫德在3月份訪問莫斯科時還表示希望會出現「新生而自願的聯邦」。他公開表示蘇聯解體對大家都沒有好處，包括西方在內。在私底下，他說葉爾欽是「危險人物」。
在該月份，貝克下令美國駐莫斯科大使館籌辦1個15個蘇聯共和國總統的會議，2大超強的地位不平等已經變得很明顯了。戈巴契夫憤怒地要各位總統都不要參加。
但西方壓力還是不斷。英國首相梅傑在4月份再度向戈巴契夫抱怨蘇聯的生物武器計畫—布萊威特大使請切爾尼雅耶夫把信轉交給蘇聯總統。
英國人一直表達關切到年底，並威脅說將不再提供經濟援助。
戈巴契夫在公投取得勝利，但對於一個衣食無著的社會來說根本毫無意義。謝瓦納茲警告蘇聯可能會在內戰中突然解體：「這是我最害怕的事。」他還說戈巴契夫應該另創一個改革派政黨，謝瓦納茲和雅可夫列夫這些人都會加入。雅可夫列夫寫信給戈巴契夫主張建立兩黨制度。他心知戈巴契夫懷疑他想取而代之，強調自己已經年紀太老。
謝瓦納茲很遺憾戈巴契夫和葉爾欽無法調和歧見。他認為葉爾欽替代戈巴契夫是不錯的人選。他承認戈巴契夫從來不想當「獨裁者」，葉爾欽卻有「威權傾向」。但如果戈巴契夫在莫斯科失勢，葉爾欽似乎比較能保證繼續改革。謝瓦納茲繼續對戈巴契夫保持忠誠，但他的前副手阿達米申卻看得出戈巴契夫讓他失望，甚至背叛他。
謝瓦納茲也覺得外交部高層已沒有什麼「戰略家」—他並不贊成拔擢別斯梅爾特內赫。
雖然他嘴上說並不後悔辭職，但阿達米申認為他只是在自我說服。
