遠雄集團董事長趙藤雄因大巨蛋案等5大案，31日遭檢方起訴，並求刑 24 年，在遠雄集團的家族企業中，趙是遠雄真正能作主的人，重大決定都由他交辦後行事，台北市長柯文哲今就對趙的即將入獄表示，市府就要跟遠雄談，到底他們現在誰可以做決定？因為如果沒有人做決定，這個案子拖下去就有問題了。
北檢於31日上午提出起訴相關文件，當中指明，北檢對趙提起公訴，認為趙違反《貪污治罪條例》之不違背職務期約、交付賄賂、《刑法》342條背信、215 條之業務上文書登載不實、《證券交易法》179條之公告申報財報不實，以及同法第 171 條，非常規交易及特別背信，犯罪所得金額達 1 億元以上，另，也涉犯《商業會計法》第 71 條之財報不實及填製不實會計憑證等罪嫌。
基於上述，檢方以趙為高度嫌疑人起訴，並出動羈押權羈押之，下午已將趙移交台北地方法院，法官召開羈押庭判斷是否釋放趙，若趙的釋放會造成後續審理困難，或審理完執行的困難，如湮滅證據、逃亡、串供等，就會持續羈押，否則，鉅額交保的可能性大，預估晚上會有結果出爐。而今日經北檢起訴後，就交由法庭審理該案，會先進入律師閱卷等程序。
柯文哲:要跟遠雄談，看誰能做決定
柯文哲31日表示，北市府就大巨蛋案，與遠雄已經進入最後的建照變更前審查階段，等於是攤牌要蓋或不繼續蓋，以及能不能符合標準。他說，北檢一起訴就要繼續收押了（事實上，還需經法庭程序），所以之後會請主談的副市長陳景峻，馬上跟遠雄明講，到底他們現在誰可以做決定？因為如果沒有人做決定，這個案子拖下去就有問題了，還說，今天下午就要跟遠雄談及相關。不過，根據遠雄說法，北市府今天並沒有與其見面商談此事。
談到更換廠商的可能，柯文哲則表示，台灣是法治國家，要動不是這麼容易，獨裁國家早就換掉了。
大巨蛋自2015年5月20日停工至今，市府與遠雄對峙多時，終於在今年9月份達成協議，往續蓋方向前進，遠雄也配合市府走復工前的都審程序，對於北檢的收押，都發局今對此表示，官司不影響在都審方面的前進，市府仍依照程序審查大巨蛋的建照變更案。
遠雄發言人:與市府一直有正常的對口
至於柯文哲關心日後遠雄誰來決定事情的問題，遠雄發言人楊舜欽表示，以前怎麼對口就怎麼對口，遠雄與市府一直都有正常的對口，包含他與總經理湯佳峯都可以是對口與決策者，他說，近4個月在處理與市府的都審議題時，也都不是趙董聯繫與決定的。
談到73歲的趙藤雄今日獲知起訴後的情況，楊舜欽表示，趙的身體因近期的調查有受到影響變瘦，精神狀態也不是很好，據他了解，也沒有特別與公司同仁談到交接等事宜。
