行政院長賴清德3日拜會國民黨主席吳敦義，這場民進黨執政後，藍綠陣營最具象徵意義的會談，前後共持續1小時15分，會後兩人對於會談內容也暢所欲言，賴清德感謝吳敦義擔任行政院長任內協助台南永康砲校遷移與美術館、會展中心建設，吳則向賴揆表達，支持台中捷運建設，但希望捷運延伸南投，吳也希望賴揆重視台中火力發電廠空污問題，最後，吳敦義承諾盡最大可能，與立院國民黨團溝通，協助明年度中央政府總預算通過。
吳敦義同時具備卸任閣揆、副總統與現任黨主席身份，但賴揆今天強調，他在國慶日慶典當天與吳比鄰而坐時即表達，希望能夠擇日親自拜會請益，因此，「今天我是向吳前行政院長請益。」
不過，相較於賴揆先前拜會蘇貞昌、張俊雄、游錫堃等卸任綠營閣揆，以及前總統李登輝、前副總統呂秀蓮，賴清德今天與會陣容更加龐大，除了行政院秘書長卓榮泰陪同外，行政院副秘書長何佩珊、立法院民進黨團總召柯建銘等人也一起赴會，儼然有黨對黨會談的架勢。賴揆表示，今天兩人會晤時間，超過吳先前規劃時間。
賴清德於會後表示，他感謝吳敦義在擔任行政院長任內對台南市的支持，「很多人不了解，以為吳是國民黨籍，賴清德是民進黨籍，所以台南市爭取預算會到處碰壁，事實上不是如此」，賴特別舉永康砲校遷到關廟、美術館興建與台南會展中心興建為例，強調上述建設都在吳擔任閣揆任內，獲得大力支持，「即便我擔任市長任內，推動市議員小型工程款改革遭遇許多困難，吳在院會上也公開鼓勵我支持我，要求我要堅持繼續做下去，點點滴滴我都放在心上。」
賴清德表示，吳敦義今天在會談中特別期許他執政大公無私、服務全國民眾、不分黨。吳同時提起高雄205兵工廠，希望賴在任內持續推動遷移，「這是他擔任高雄市長任內推動國營事業遷移所剩下的一件，現在還放在心上。」
另外，吳敦義也針對台中火力發電廠空污問題，希望行政院拿出對策有效解決，同時表達支持台中捷運系統系統興建，「但是不要忘記（延伸）到南投。」
最後，吳在會談中也談到兩岸問題，賴揆表示，吳希望兩岸應該力求和平，如果能穩健發展，對台灣、中國與區域和平，都很有幫助。賴揆表示，對於吳敦義的幾點指教，他都非常感謝，行政院也會好好推動。
吳敦義表示，國家當前遇到重大課題，賴揆擔任行政院長，包括一例一休，如何讓勞資雙方重建和諧互助、共創雙贏局面非常用心，賴揆今天針對雙方會談內容轉述條理分明敘述非常清楚，「我很高興把我想法提出，例如台中火力發電廠造成霾害很嚴重，包括台中市、彰化、南投甚至雲林都受到很大健康威脅。」
接著，吳敦義也釋出善意，強調賴揆會中特別提到希望民國107年總預算能順利付委，這項建議，他會盡最大可能協助接洽國民黨團，在國家進步發展福祉有幫助下，讓國家總預算付委，「這是國家重要施政，我會盡我最大可能。」
吳敦義說，他與賴揆雖是不同黨籍，但都希望台灣好、中華民國好、兩岸和平發展，本著這基本信念造福台灣，希望締造公道均富社會，今天雙方談話很有共識，祝福賴揆施政成功順利推展。
