三十日的抗議活動以暴力收場，這不僅沒有止息市民抗議，反而激起了第二天的新一輪抗議。三月三十一日白天，政府門口仍然是數千人抗議，氣勢不減前日。
學生也沒有缺席這場運動，茂名第十五中學的鄭同學是其中之一。示威出現後不久，校方要求學生簽署協議書，內容是要學生承諾同意PX項目，並且不會前往市委前草坪參加抗議活動。三月三十一日下午放學前，當這張協議書發到鄭手上時，他幾乎沒有考慮，就在幾秒鐘之後將其撕毀成碎片。然後和三十餘個同學衝出學校，直奔草坪。
王永仁當日仍然守在示威門前，他說，前一日的暴力激怒了民眾，這一天人們的情緒更大，當日六點清場，暴力依舊，王永仁還第一次體驗到了催淚彈的味道。
警方清場後，市委門前的馬路被警方守住，市委東、西兩側的光華路和人民中路成了「主戰場」，連續幾天出現在事發現場的王永仁說，「到了晚上，茂名一些周邊鄉鎮的社會青年開始和警方對峙，他們白天不出來，凌晨開摩托車出來活動，當地叫飛車黨，很多破壞活動都是他們造成的」，這樣的對峙一直持續到凌晨兩、三點。
抗議第一天時，市民張金升覺得自己只是圍觀群眾，可被清場被警察打了一棍後，他第二天成了抗議市民。不過他只是在市委附近的人民南路遠距離喊喊口號。據張金升觀察，當夜警方用多輛大巴調集警力，將人民中路附近路段兩端堵住，與抗議人士對峙，不少市民受傷，他看到七八個受傷不省人事的市民被警察抬上大巴，而這載有傷者的大巴最終向市委方向駛去。
多名傷者躺在地上
據傷者家屬廖武回憶，他當晚便去市委討說法，無人回應，但他在市委旁邊空地上則看到了多名傷者躺在地上。
有人在對峙中受傷，也有沒參加抗議的人被警察誤打。在東莞打工的廣東湛江人廖文利用清明假期來到茂名和哥哥廖武團聚，四月一日凌晨（即三月三十一日晚上），他們到茂名鬧市區荔晶大酒店隔街的「梁記灌湯小包」店吃宵夜。據廖武回憶，當時有一排警察，大概三十幾人，來到梁記店面門口，要求幾個過路人蹲下檢查，警察都頭戴鋼盔，手持警棍。幾分鐘後，大批警察突然衝入梁記店內，直接奔向正在吃飯的廖文，要求他伸出手掌。廖文照做後，警察沒有再問任何話，逕直將其拖出門外，在街道上開始暴打。廖文形容，警察的拳腳就像「雨點一樣落下來」，對其暴打，並使用警棍，整個過程持續三十多秒。廖文稱除自己之外還有六個人被打。而從飯店提供的監控錄像可以看到，一個警察的警棍都被打彎了，要靠旁邊的大樹借力掰直。
弟弟被打時，哥哥廖武試圖上前阻止，但警察完全不聽，廖文記得自己曾喊「我是冤枉的」及「我是湛江人」，意為和茂名的示威事件無關，但警察回說「湛江人又怎樣」，繼續打。最終，廖文左手被打得骨折，背部、腳部和腿部明顯有被棍擊的傷痕。
