行政院長蘇貞昌及相關部會首長23日赴立法院列席報告中央政府嚴重特殊傳染性肺炎防治及紓困振興特別預算第4次追加預算案編製經過並備詢，台灣民眾黨立委邱臣遠質詢時，要求中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中，對先前在國會誤稱3+11會議是由副指揮官陳宗彥召開道歉，並下台以對3+11實質負責。陳時中最後道歉，但蘇貞昌則出面力挺陳時中表示，「對一個這麼認真指揮官，要他下台是不對的」。
邱臣遠在質詢時播放影片質問，陳時中5月28日在立法院朝野協商時答詢說，3+11會議是由陳宗彥主持，陳時中立刻回應，當日下午就已致電給邱臣遠坦承講錯，隔天也在記者會澄清。
不過邱臣遠表示，國會殿堂是最高民意代表，在國會上的發言有誤，「是不是應該公開向本席和立法院道歉，目前還沒接受到歉意」，並指出陳時中與立委交鋒時也未理性表達。
邱臣遠：陳時中多次表示「3+11我負責」，但怎麼負責？
陳時中最後道歉表示，「如果有人認為我講錯話，我感到非常抱歉」，邱臣遠聽完回覆，「好，謝謝你非常誠懇的道歉。」
邱臣遠表示，陳時中多次向外發言說會對3+11負責，但該如何負責？是要立刻請辭下台、等疫苗2劑覆蓋率達60%再請辭負責，還是向染疫的亡者3鞠躬以示負責，還是認為防疫功大於過不需負責，或是根本沒有錯，不用負責。
陳時中回應，政務官本於良知良能，做好份內的事，3+11案情已經控制，並反嗆「我不知道你的想法怎麼樣？如果你的想法是3+11衍生到5月的疫情，我們的報告也寫得很清楚，沒有關聯」。
邱臣遠指出， 聽起來陳時中並沒有要正面回答，認為陳時中這樣的態度，可能也是不想負責。蘇貞昌則表示，說3+11是破口是不對的，諾富特病例的感染早在實施3+11之前就發生，5月疫情更已證明2者沒有相關，並說現在病例每天都控制在個位數，「對於這麼認真的指揮官陳時中，要他下台是不對的」。
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