HPV人類乳突病毒有接近200種類型，部分類型會透過性行為感染人類生殖器及周邊皮膚，目前已證實會導致包括女性子宮頸癌、陰道癌、外陰癌，男性陰莖癌，兩性的肛門癌、頭頸癌及菜花等6癌1病，其中子宮頸癌高居女性主要癌症第8名，口腔口咽及下咽癌居第6名（不分男女）。
雖然HPV感染可以經由疫苗來預防，但由於大眾對於HPV的認識不足，尤其是對男性的致癌風險，疫苗接種率仍然很低。另外，國健署現階段從提供公費HPV疫苗施打的性別、疫苗價數到保護的型別，都無法滿足台灣臨床上與HPV相關的頭頸癌防治需要。
公費疫苗執行3年 性別、價數與保護型別應檢討
監察委員王幼鈴、田秋堇於2018年曾發出新聞稿，質疑「男性感染HPV病毒比例亦不低，免費疫苗接種排除男性的理由及依據為何？有無涉及差異待遇？」針對衛福部推動HPV疫苗免費接種政策提出疑慮並申請自動調查。
如今，國健署實施國一女生公費接種HPV疫苗政策已經3年，除了重新檢視上述HPV疫苗保護的價數、型別以及HPV衍伸致癌的醫學研究證據外，就國家整體性的公衛政策思考，男女健康權的平等，不分縣市民眾的健康權平等，並沒有被公平看待。
常見52、58型未涵蓋 現行疫苗防護力恐不足
世界衛生組織（WHO）2018年呼籲世界各國，應將子宮頸癌視為公共衛生目標「A world free of cervical cancer」；2020年又發表幫助全球消滅子宮頸癌的策略，預定2030年以前要消除HPV病毒的健康危害。衛福部國民健康署自2018年底起，為防治子宮頸癌，針對全國的國一（七年級）女生，實施全面接種HPV疫苗的政策；這也是回應WHO的一項重要政策。
然而，衛生福利部國健署現階段公費施打的HPV疫苗，主要能防護HPV16與18型2種病毒型，但根據中央研究院院士陳建仁教授（2011年）發表的研究顯示，另有第58和第52型在台灣盛行率高達44.6%。林口長庚醫院賴瓊慧教授（2007年）研究指出，HPV第16、18、52、58等型盛行率高達90.9%。
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依此台灣本土HPV的醫學研究看來，目前國健署全國施打的公費疫苗，並未能完全涵蓋這些台灣常見的型別，疫苗防護力有20%到30%的落差。台大醫院副院長、耳鼻喉部教授婁培人醫師認為，依靠目前的公費疫苗，想要達成WHO在2030年將子宮頸癌發生率降至「6/100000」以下的目標恐怕是做不到的。
