台灣學生聯合會副秘書長蔡一愷指出，「清華海峽研究院」事件與近年來清大校方「兩岸清華一家親」的發展方向，若不謹慎處理，恐將對清大理工科系學生赴美留學、就業，甚至在台就業造成嚴重負面影響。鄭重籲請清大校方停止「兩岸清華一家親」的校務發展策略。
政府努力建立台美科技 「清大竟成高科技破口」
立委范雲表示，全球半導體產業都在區隔紅色生產鏈，政府也努力捍衛經貿外交，建立台美在科技上的互信；卻發現我們的後院、國家重點培育的清華大學，居然成為高科技的破洞，影響跨國戰略互信。
范雲表示，立法院上會期才通過《國家重點領域產學合作及人才培育創新條例》，重點就是半導體產業，清華大學已經得到國家支持成立半導體學院，成為國家資源、人民納稅錢挹注的重點高科技培育重鎮，卻仍持續說謊，對不起所有清華人和清華培育的高科技人才。
范雲批評，時任清大副校長吳誠文曾參加設立辦公室的揭牌儀式，難道是路人甲嗎？校方請不要再說謊，作為高等教育領導人，應該誠實以對，有錯則改。
台灣清大有中資捐助嫌疑 范雲：勿拿學術自由當擋箭牌
范雲指出，清大也疑似有中資捐助問題。2018年6月，宣稱3個月前才在瑞士成立的「海納百川區塊鏈投資諮詢有限公司」在W飯店舉辦「海納百川區塊鏈商學院」開幕揭牌儀式，與會者包括清大科法所所長范建得、研發長曾繁根，以及海峽經濟研究院副院長黃佩儀。後來，清大接受海納百川區塊鏈商學院及眾勤法律事務所捐助1000萬，該「海納百川商學院」被發現背後就是中國官方一帶一路基金會，有中資疑慮，最後才改為眾勤事務所獨家捐款。
范雲表示，海納百川公司在台灣也設立公司，但資本額僅500萬，更在不到2年就解散，公司負責人正是身兼海納百川創辦人與眾勤事務所的所長。她認為，這可能已經是另一種中國透過民間單位繞道進入台灣的模式，清大應該積極配合教育部、陸委會甚至國安單位展開調查。
范雲呼籲清大，不要拿學術自由當擋箭牌，並呼籲教育部亡羊補牢，在大學法和相關法令仍有漏洞之下，必須全面調查，立法防範；清大將責任推給清大校友會，然而目前的法規中，校友會在國立大學校長遴選中扮演重要角色，如果校友會用自強基金會當作白手套，是非常嚴重的事情。立院也應加速審查兩岸關係人民條例、國家安全法等修法。
