總統府1日舉行元旦升旗典禮，台北市長柯文哲一度獨自在貴賓區「罰站」近40分鐘引發爭議。總統府發言人張惇涵表示，1日6時3分三軍儀隊操演時，除了總統、副總統及主辦單位5大醫事團體代表以外，其他重要貴賓都已在現場站定位，盼各界不要誤解。
張惇涵2日表示，1日總統府便公開說明，如有安排不周之處，請柯文哲見諒，而1日午間也有向台北市政府聯繫致意。2日稍早，總統府副秘書長李俊俋已致電台北市副市長黃珊珊，總統府秘書長李大維也已致電柯文哲，再次表達總統府的致意。
張惇涵：基於防疫考量，才安排柯文哲先就位
張惇涵說明，今年總統府元旦升旗典禮首次由5大醫事團體共同主辦，主辦單位加上領唱國歌的防疫英雄，在總統府內準備的人數已超過80位，人數比起往年較多。因此，基於防疫考量，才比照其他重要貴賓的方式，由工作人員導引，安排柯文哲先至活動場地就位。
張惇涵表示，還原1日狀況，總統府貴賓證上通知貴賓到場的時間為5時50分前，柯文哲抵達總統府的時間約為5時37分。其他重要貴賓例如：參謀總長5時30分左右即已抵達，監察院長於5時39分抵達，立法院長則於5時46分抵達，隨即由工作人員引導至活動現場就定位。
張惇涵：除總統、副總統及主辦單位5大醫事團體代表以外，其他貴賓都已在現場
張惇涵說明，大家看到柯文哲身邊都是空位的畫面，是因為安排站位在柯文哲身旁的貴賓，是主辦單位5大醫事團體代表；而這些代表在6時20分左右與總統、副總統一起至現場就位。因此在6時3分三軍儀隊操演時，除了總統、副總統及主辦單位5大醫事團體代表以外，其他已經到場的重要貴賓都已在現場站定位，盼各界不要誤解。
張惇涵強調，對於重要貴賓蒞臨國家重大慶典，總統府皆由衷感謝並予以接待，不會有政治考量。若活動安排有不周延之處，總統府願再次表達，希望柯文哲能夠諒解。總統府感謝柯文哲1日出席，並感謝北市府各單位辛苦的工作人員，對於總統府元旦升旗典禮的支援協助。
