準教育部長吳茂昆擔任中國中科院的顧問，引發爭議。國民黨發言人洪孟楷17日爆料指出，吳茂昆接任顧問期間還橫跨東華大學校長期間，要求吳茂昆應釐清爭議再上任。洪孟楷也說，民進黨檢視中研院院士管中閔就任台大校長的標準，應該也要以同一標準來檢視部會首長。
洪孟楷今日上午舉行記者會指出，有看不過去的人士，提供吳茂昆過去在對岸擔任官方資助的「中國高等科學技術中心顧問委員會委員」凝聚態物理類委員的訊息。
洪孟楷指出，吳茂昆擔任顧問的時間從2010年開始，竟然橫跨吳茂昆擔任東華大學校長期間，更讓人感到詭異的是，在今年3月左右，對岸官網上的顧問資料突然全部變成無效頁面。
洪孟楷說，就中國高等科學技術中心官網顯示，該中心是由中國科學院、中國財政部、國家自然科學基金委員會支持，目的是幫助中國科學家在國內做出有世界水平的研究成果，為全世界科學技術交流與發展作出貢獻。
洪孟楷說，吳茂昆是否要向台灣人民交代一下，從2010年開始接任的顧問職，有受到中國財政部的資助嗎？而有為中國科學家做出交流貢獻嗎？從2010年到2018年止，當中歷經東華大學校長階段，是否有向教育部報備顧問職一事？還是隱匿未報故意欺騙？
洪孟楷：吳茂昆2016年10月參與中國「實用化高溫高導材料產學研合作組」成立大會
洪孟楷說，另外一份資料顯示，2016年10月吳茂昆院士前往北京參與中國科學院高能物理研究所的「實用化高溫高導材料產學研合作組」成立大會，並且擔任合作組顧問職，而就新聞稿顯示，該合作組每3個月開會一次，聽取各項目工作進展報告、協調合作事項，並要為國民經濟發展作出實質貢獻。
洪孟楷質疑，從2016年10月起，吳茂昆應至少參與該組織5次聚會，請問這5次是否由對方招待？有無利益交換？是否收取報酬？都請吳茂昆向國人說明清楚。
洪孟楷也說，據中國科學院高能物理研究所官網顯示，這是1973年根據前總理周恩來指示組建而成，換句話說，這就是中國官方學術機構，吳茂昆也該說明清楚為何前往擔任顧問？
洪孟楷說，兩岸學術正常交流絕對是值得鼓勵，如果吳茂昆能夠上任，那應該在2月1日就上任的管中閔應先就任，且管中閔是遴選出來，其正當性比指派的吳茂昆更足夠，如果不讓管中閔上任，吳茂昆也別想就職，一個國家不能有兩套標準，請吳茂昆出來面對，也請蔡英文政府出來說清楚講明白。
