新任教育部長吳茂昆今（17）日遭國民黨指控曾任中國科學院顧問，對此他透過教育部新聞組發出聲明表示，台灣中研院物理所和中國國家科學研究院，從2008年起就簽署合作協議，雙方研究員彼此參與學術交流和活動，所有中研院的研究員都是公務人員，赴中國必須事先申請，所有交流都是短期的學術演講，他也都依規定赴中交流。
吳茂昆表示，與中國科學院的合作僅止於短期的學術演講交流，雖有該院的研究員希望他在部分計畫上能給予更多資訊，但他並未答應任何職位，也未參與後續相關的會議。
他也提到，所有交流都是短期的學術演講，赴中國的中研院研究員都是公務人員，他也都有依規定申請，以此駁斥國民黨對他赴中的疑慮。
