台南市議長選舉備受外界矚目，而綠營派系之間過去地方的矛盾也讓內鬨再起，甚至台南日前發生的88槍擊案，也被提起討論。有一民進黨政人士指出，台南市議長選舉尊重台南市議會黨團、督導小組的相關討論，即便過去副總統賴清德曾經擔任台南市長，但是他與台南市議長選舉無涉，也不會介入，此局與他並沒有關係，都是地方自行決定人選，賴清德也沒有任何參與討論，是地方自行處理。
針對此次的議長選舉，擔任台南督導小組召集人的市長黃偉哲6日在台南對外表示，依照民進黨今年選的結果及盟友支持，議長選舉應該能有比較好的結果，其他縣市的民進黨席次取得雖沒那麼多，但都能在「相忍為黨」前提下，能夠有一個好的結果，不希望反而是相對選得比較好的台南，有任何出走狀況。
黃偉哲昨（7）日在民進黨中常會後受訪指出，他比誰都希望槍擊案破案，專案小組是由地檢署、刑事局、台南市警局、南打中心混合編隊，沒人能把資訊隻手遮天，希望不違反偵查不公開由專案小組適時公布偵辦進度及方向，這是對社會負責的做法。有人稱和光電有關，又說與議長選舉有關，到底跟什麼有關？都要尊重專案小組的辦案，黨團正式決議推舉的正副議長人選，就是要一致性投票，若有重演4年前的「跑票」情形，當然要依照黨紀處分。
針對台南88槍擊案，民進黨中執委郭再欽遭民進黨立委陳亭妃質疑，不過，有一民進黨台南地方人士指出，此事件相關單位都有在偵辦中，而在槍擊案中，郭再欽是遭到槍擊的當事人之一，要將此事件直接與他，並與議長選舉做連結，並不公允。
