同時，他也認同公務員應該調薪，並指出自己在北市府時，各局處裡的「約聘雇人員」採核點數制，可雇員額少但薪資高，讓政府單位引進企業經營精神，避免僵化，或薪資與業界行情落差太大，聘不到合適、優秀的人才。
推《特別預算法》修法 主張重建補助款與統籌款機制
針對財政紀律，柯文哲提到，台灣各縣市裡，有16個自籌財源不到50%、8個不到20%，當主要財源靠中央撥給，地方自治就難成，要看中央臉色，看政黨顏色分配預算，為此，他主張重建「補助款與統籌款」機制；地方財政自主，均衡發展；翻新稅制，改善課稅不公；落實財政紀律，修《特別預算法》，不再胡亂撒幣。
針對司法改革，柯文哲主張設置常設性的「司法改革委員會」，落實司法改革會議決議。提升司法系統的透明與公正度；設置「國家司法科學委員會」，以改善司法科學、鑑定制度。並採納民眾黨不分區立委候選人黃國昌等建議，推動《吹哨者保護法》，以及《刑法》中「不法餽贈罪」、「影響力交易罪」、「妨害司法公正罪」、「司法關說罪」、「棄保潛逃罪」、「湮滅證據罪」、「藐視法庭罪」、「恐嚇騷擾行賄證人罪」等罪章，以期有效打擊犯罪。
針對政府數位治理上，柯文哲主張完善數位基礎建設、推電子身分證，，提升「個資保護委員會」為二級獨立機關，以保護個資；設立「國家數位轉型會議」，完善數位相關法制，加重處罰洩漏個資公私部門；產業轉型輔導，鼓勵培育數位人才。
柯文哲也舉例，他在北市府離任前，北市府電子公文比率達到99.85%，公文處理時程平均壓到2天以內。他也舉例，新加坡在疫情期間，派了1000個年輕人到各小吃店教導數位支付，國家應協助輔導業者數位轉型。
