近年關鍵基礎設施防護成為軍方、警方重點演練之一，不過目前最頭痛問題在於「第五縱隊」於戰時對關鍵基礎設施的破壞，對此，國防部則表示，平時運用「區域聯防」機制與各單位防護，戰時由重要目標防護部隊進駐，負責統籌關鍵基礎設施防護單位內保警、民防團隊、特種防護團等單位，確保設施安全。
《自由時報》援引不具名官員說法指出，在台第五縱隊確實越來越多，同時軍方已規劃憲兵防衛關鍵基礎設施，不讓潛伏在台的第五縱隊有機可趁。
對此，國防部則表示，國軍遵行政院國土安全辦公室策頒「國家關鍵基礎設施安全防護指導綱要」，平時運用「區域聯防」機制，規劃常備部隊防護兵力結合地方政府、憲、警、消及調查局等單位，共同遂行關鍵基礎設施防護與危機處理。戰時由重要目標防護部隊進駐，負責統籌關鍵基礎設施防護單位內保警、民防團隊、特種防護團等單位，確保設施安全。
國防部指出，持續配合行政院國土安全辦公室年度「金華演習」、關鍵基礎設施防護演習及結合戰備部隊偵巡等時機實施演練驗證，強化設施安全防護能力與韌性。
事實上，在去（2023）年漢光39號演習中，在桃園煉油廠部分就有保二總隊、軍方一起共同操演，顯見軍方早已意識到重要性，據悉，今（2024）年的漢光40號演習，仍會有類似科目出現，規模甚至有機會更大。
