海基會董事長鄭文燦上任才一個多月，涉嫌在桃園市長任內收賄500萬元，遭檢調約談後依《貪汙治罪條例》等罪嫌，於7月6日生日當天遭聲請羈押禁見，法院裁定新台幣500萬元交保並限制住居及出境。海基會7日表示，鄭文燦董事長基於避免影響團隊政務推動，已請辭董事長職務。鄭文燦董事長珍惜從政的價值初心，將在司法程序中，全力捍衛自身的清白。在推舉海基會董事長新人選前，由副董事長兼秘書長羅文嘉代理。
鄭文燦於4日從日本返國，5日清晨6點多就被調查局桃園市調查處從台北住家帶走，應訊過程保密到家。此案傳出後，在國內政壇投下震撼彈，鄭文燦交保後對媒體追問皆微笑不語，委任律師在召開羈押庭時代鄭發聲明，指「自己沒有不法行為，一切會配合司法調查，希望能盡快釐清真相，證明清白」。
鄭文燦昨在交保後，於深夜發出簡短聲明強調，「我親愛的朋友，我是文燦，經過兩天的漫長偵訊，下午法院裁定交保，我已經回家休息。我從政以來，公而忘私，不貪不取，這是我很珍惜的價值。我也會在未來司法調查的過程，捍衛自己的清白。」
