副總統蕭美琴上任後，警衛室以「安平」為代號，象徵她以身為台南人為榮。特勤人員「以身作盾」維護正副元首安全，被視為是無名英雄，平時服飾多以灰色、藍色為主，且都會掛上耳麥，並在領口別上特勤中心小徽章，其實辨識度並不低。有趣的是，安平警衛室近期的一項改變，讓特勤中心大為驚訝。
警衛室屬於任務編組，不是正式編制，各警衛室之下的人員，若是軍職，編制則在總統府侍衛室；若為警職，則在警政署保六總隊第一警官大隊，借調至總統府；總統警衛室主任多由副侍衛長兼任。正副元首只要出席活動，除各自的警衛室外，特勤中心也一定會派員戒護，但兩邊依舊有區別。
