新北投車站從彰化移回新北投原鄉是許多人的願望，但最大的爭議卡在地點，究竟要採取微調原址的A方案，還是距離原址50公尺外的D方案。從前市長郝龍斌到現任市長柯文哲都採取D案，在地文資團體則持續抗議市府黑箱。眼見距離老車站100歲只剩不到1年的時間，重建前的都市計劃審議都還沒通過，重建的路仍顯迢迢。主政的文化局長倪重華面對文資團體強烈的反彈聲浪，除表示「如果讓每個人都滿意的話，就是文化鄉愿」，還對府內「開發派」人士有所抱怨。
A案有交通安全疑慮 D案文資團體不買帳
新北投車站仍停留在「暫定古蹟」階段，在彰化拆解後，移回新北投的哪裡是一個很大的爭議。文資團體強烈主張，應採原址重建的A方案，再現昔日帶狀地景，即「以道路遷就文資」，但因今日的地景已與昔日有別，當前該路段為7岔路口，道路更改不易，市府與一些在地居民都認為原址重建會構成交通上的人、車、文資三重危險，故主張在距離原址50公尺處重建（D方案），如此也算是廣義的「原址」。
此爭議在郝龍斌主政時期就曾召開過2次公民會議，並在郝任內決定為Ｄ案。現任市長柯文哲上任後，由於有文資團體仍堅持原址重建，柯市府又於6月28日召開公聽會，讓登記發言的民眾有3分鐘能發言，但會議結束前，卻直接宣布柯市府最終決定為D方案，遭文資團體痛批「公聽會開假的」。
雖說公聽會沒有法定拘束力，市府沒有義務採用，但就連市府內部都有人認為，柯文哲早在3月4日公聽會上就定案採用D方案，6月28日當天公聽會操作不當，讓原本蒐集民意的公聽會美意成了爭議的焦點，掀起更大的波瀾。
文化局長倪重華在接受專訪時表示，市府最後會做出這樣的決定，是匯集民意的結果。而民意是根據什麼？倪重華表示，里長帶來了524份在地居民聯署同意書，書中表明「同意新北投火車站重組設置於七星公園大榕樹旁（D案）」，還提到「A案在光明路中間，完全不可行」，連署同意人包括立委丁守中、士林北投區近8成市議員（除陳政忠、何志偉、吳碧珠外），以及1/3在地里長的支持。
然而，爭取A案的BATTAO自主行動聯盟代表蕭文杰搬出聯合國憲章，指歷史建築的意義與該歷史發生的場景不可分離，若搬離原先的位置，就失去了原味，應藉此機會修改路型，且路型修改是可行的。而記者詢問是否考慮「以路遷就車站」？文化局主秘劉德堅表示，交通局做過相關專業評估，若為了文資修改路型，將使得路幅更窄，阻礙車行、構成危險。
