第1單元的「早期台灣」有5處變動，當中強化了漢人來台的部分，增入宋元對澎湖的經營，加入史實有爭議的顏思齊、刪除濱田彌兵衛事件與麻豆事件，減少介紹早期漢人殖民社區；也減少對大航海時代的介紹。另外，恢復傳統西方列強興起與殖民地擴張的內容，刪除台灣與世界體系互動的部分，「荷西治台」改為「荷西入台」。將「鄭氏王朝」改為「明鄭」，刪除鄭氏王朝與國際互動的部分，包括明鄭與荷、英所訂條約的內容，其與清朝的談判，改為強調其覆亡的過程。
第2單元的清朝統治時期，則將清朝改為清廷，並強調原有的鴉片戰爭、羅妹號事件、牡丹社事件，也大幅度增加中法戰爭的內容，另外也強調清朝時台灣的現代化建設。
第3單元的日本統治時期，則加2字，改為「日本殖民統治時期」。加入日本時代台灣與中國的互動，如孫文來台尋求對中國革命的支持，以及五四運動對台影響等。另外淡化日本對台灣建設的內容，強調日本殖民統治，日商的經濟壟斷與剝削。
第4單元則是中華民國統治時期，原課綱以政治、經濟、社會、文化分別介紹，改定後，大幅增加了政治方面的內容，社會文化合併為1節，大幅刪減文化發展方面的介紹。以光復取代接收，強調政府各項施政的正面成就，將經濟發展成果與政府政策連結，刪除環保方面的影響。
其中，台灣地位與兩岸關係中，刪除與兩國論有關部分，避免提及中華人民共和國的存在，改為中國大陸，模糊了台灣的角色。
