針對國民黨指控民進黨2012年大選補助款1/3款項成為「黑箱經費」，民進黨發言人鄭運鵬表示，民進黨該年的總統大選的補助金，是依《總統副總統選舉罷免法》規定，依法由黨中央代為領取，並按黨內規定，2/3撥回候選人，1/3留給黨中央運用，依會計師建議，民進黨將黨中央1/3列為「其他收入」，國民黨稱這筆款項消失在民進黨決算書，是無端指控。
鄭運鵬說，每個政黨、團體在會計作業上，各有不同的科目編列原則， 更何況民進黨每年的會計決算報告，都依法在會計師查核簽證後，送交內政部備查，並向國人公佈，所有資訊都是公開透明，絕無所謂的「黑箱經費」之說法。
鄭運鵬強調，在民進黨的財務報告書上，每一筆收入都是由黨員的黨費、人民的小額募款及各種選舉補助金而來，每一筆都清清楚楚，清清白白。民進黨財務報告書上所沒有的，就是國民黨龐大，民主政黨不應該有的黨營事業信託等收入，這些每年動輒十數億將近20億收入，是國內所有政黨全年收入的2倍以上，而這些經費投入選舉，造成政黨間不公平競爭對台灣民主所造成的傷害，更是無法估計。
鄭說，國民黨挟龐大不當黨產，至今不願意還給人民，還繼續用在選舉，造成不公平競爭，傷害民主政治，現在還指鹿為馬，蓄意抹黑，實在連起碼的反省能力都沒有。
