國民黨是百年政黨，在政壇上被定位為外來政黨，本土與外省的路線之爭從未間斷，不過，因為這次總統參選人是統派色彩濃厚的洪秀柱，讓本土派的焦慮完全爆發，不少本土派立委紛紛跳船。一位國民黨本土派的要角直言：「這是國民黨前所未有的危機。」
本土派為了自保，在總統選戰恐已無力回天，只好在立委選戰找尋戰場，希望能透過區域性的串連，來拯救國民黨本土派的選情，也希望可以將國民黨的頻譜可以守住，不要讓國民黨的路越走越窄。
李登輝離開 外省黨標籤如影隨形
事實上，國民黨的本土派與外省派一直都在黨內搶地盤，本土派一直都不是主流，2000年首次政黨輪替前，前總統李登輝還在國民黨，因此，國民黨的外來色彩無法被完全抹上，但隨著李登輝離開國民黨，外省黨的標籤始終如影隨形。
2008年，國民黨重返執政，總統馬英九帶領國民黨奪回行政權。本土派要角表示，雖然馬英九也是外省人，不過，馬英九的兩岸立場是「非台獨」，國民黨與民進黨在路線上是「台獨」與「非台獨」之別，因此，本土派的焦慮雖然有，但都被隱藏住。
從「台獨」與「非台獨」 變「獨」與「統」之爭
「洪秀柱的色彩濃厚，讓本土派久藏的痼疾無法繼續躲藏。」本土派要角指出，馬英九立場是非獨也非統，因此藍綠就是「台獨」與「非台獨」，但洪秀柱的色彩濃厚，變成「獨」與「統」之別。
這位本土派要角指出，跳船潮就是最好的例證，「在這樣的統與獨之爭下，怎麼有辦法存活？」他直言，「這些人（本土派）有被消滅的危機，當然只能跳出來，希望能讓國民黨維持原來的光譜，不能越走越窄。」
本土派立委 不投入選戰
包括像彰化的鄭汝芬、雲林的張嘉郡、嘉義的翁重鈞，都是本土派的代表，連副主席黃敏惠也未投入立委選戰。
輔選幹部表示，覆巢之下無完卵，以選戰打法來看，切割絕對不是解決之道，立委參選人寄望與總統「分開選」，但其實只是一廂情願的想法，唯有總統與立委一起選，才能讓選情從底層往上加溫、炒熱，但問題是，炒熱選情之後卻對自己不利，大家的焦慮就更高。
