有醫師質疑公費流感疫苗政策；疾管署副署長莊人祥今（2）日澄清，公費流感政策以打造群體保護力為主，優先給高風險者跟高傳播族群，600萬劑可達25%群體保護力。
《聯合新聞網》民意論壇刊登一篇醫師投書，認為公費流感疫苗走岔了路，且說2009年新型流感大流行時，政府用掉1500萬劑疫苗，仍有41人死亡，多是肥胖者、孕婦，很多都沒打疫苗，且認為目前的政策是以兒科觀點制訂成人疫苗政策。
9年前41死 疾管署：多接種前即感染
衛生福利部疾病管制署副署長莊人祥表示，2009年大流行時，購入約1500萬劑疫苗，但截至當年12月底，約打了500多萬劑，占全人口22%；死亡的41人多是在還沒打公費流感疫苗前就已感染的病人。當公費流感疫苗開打後2週，疫情也就明顯下降、很快就被控制下來。
莊人祥說，投書指出，流感疫苗政策都是以兒科觀點，但有關疫苗接種決策的傳染病防治諮詢會（ACIP）組成並非只有兒科專家，也有感染科、婦產科、公衛專家等，絕無獨尊兒科。
另外，他也表示，訂定疫苗政策的關鍵是「群體保護力」。根據研究顯示，在流感大流行時，若大家都沒有施打疫苗，病毒進到人體後，平均每個人可以再傳染給1.3個人，推算後若群體免疫力能達到23%以上，就有群體保護效果。
目前每年公費流感疫苗約600萬劑，群體免疫效果可達25%。
莊人祥說，目前公費流感疫苗政策並非全面接種，而是針對高危險群，如50歲以上、有慢性病、肥胖、孕婦、嬰幼兒；也針對高傳播族群，如在校園的學生，在有限經費下做到最好。
流感高峰 落在元旦、春節
根據統計，截至11月29日止，公費流感疫苗已接種439萬劑，3歲以上適用的0.5mL劑型剩餘量約72.6萬劑，仍有3200家合約院所可提供接種服務；6個月至3歲以下幼兒適用的0.25mL劑型剩餘量約12萬劑，有1912家合約院所提供接種服務。
莊人祥呼籲，往年流感大流行高峰約落在元旦和農曆春節間，民眾應及早準備，符合公費資格者盡快施打疫苗。
