台南市長賴清德9月30日在市議會答詢時，一連説了3次「我主張台灣獨立」，但強調不主張兵戎相向。對此，國民黨立法院黨團10月1日召開記者會，質疑賴清德與民進黨總統參選人蔡英文的「維持現狀」背道而馳，國民黨立委吳育昇更批評，賴清德根本是「台獨登革熱」，搞這種政治的登革熱要死多少人，應該和民進黨來個統獨大辯論。
國民黨團書記長林德福、政策會執行長賴士葆、立委費鴻泰及吳育昇，上午召開「賴痞台獨論，蔡英文怎麼説？」記者會，要求蔡英文出面回應賴清德的「主張台灣獨立」，並砲轟民進黨不要只想著吸收深綠和中間選票，就大玩兩面手法，若蔡英文不講明白，那就是貫徹「空心菜」的形象。不過民進黨不以為然，認為國民黨立委此時召開記者會，根本是因為自己的選情低迷。
對此，吳育昇駁斥，民進黨此話根本是「滑天下之大稽」，難道賴清德公然主張台灣獨立，「我們國民黨不能回嘴嗎？我們國民黨不能反對嗎？」他指出，賴清德談台灣獨立，根本不是在捍衛中華民國，所以才補上一句「不主張兵戎相向」，完全就是心裡有鬼，或是提名副手無望，就決定扮演「鷹派」。
吳育昇也説：「我們捍衛中華民國這麼多年來，老共有打我們嗎？敢打我們嗎？能打我們嗎？我們主張一個中國各自表述，中國共產黨敢主張我們不對嗎？拿武力來威脅我們嗎？」民進黨想要圓謊，卻只顯得自己更顢頇無能。
「賴清德自己被蚊子叮，你不要把台南的登革熱，搞成用台獨的主張、搞成台灣政治的登革熱！」吳育昇也批，賴清德根本是「台獨登革熱」，台南市已經因登革熱死了20多人，現在還要搞這種政治的登革熱，「要死多少人你知道嗎？」
此外，吳育昇上午在立法院質詢陸委會主委夏立言時，也拿出陸委會進行的例行民調數字，指出年輕世代支持台獨的比例高居不下，他建議，陸委會應「去跟學校溝通」。夏立言則回應，賴清德的主張與中央政府立場完全不同，那是個人意見表達。
