北藝中心硬體工程大延宕，落後原定進度15%以上，引發台北市長柯文哲關注，並親至工地現場勘察。市議員吳思瑤則提出另一同樣棘手的問題，即後續的軟體營運以「一年一標」的方式招標，輕忽藝術專業性的制度設計。對此，文化局回應，僅在「試營運」階段為之，之後便有行政法人接替。
吳思瑤表示，文化局當前以一年一標的「標案」型式招來廠商營運軟體音樂、戲劇等節目，她說，依照國際標準，沒有大型的藝術中心這樣做，多半是4-5年一標，因為節目的籌備需要長時間的規劃，尤其是大型的、國際級的表演節目，但今日文化局的做法卻讓承攬的軟體商，沒有辦法規劃更多需要更長時間準備的優質節目。吳表示，這種作法「笑掉國際大牙」
吳提到，一年一標的制度設計是輕忽專業，會讓未來營運難以營運，也非長遠之計，沒有好的節目、安排不出國際級的節目，再好的硬體也無用。
對此，文化局主秘劉得堅表示，以一年一標的方式營運軟體，是短期內的「試營運」階段才會這樣做，長期而言，還是會成立行政法人來營運，也就不會有換人經營的問題。
