針對教育部長葉俊榮任命管中閔為台大校長，總統蔡英文今（26）日晚間在臉書強調，「一個清楚的事實是，無論是台大校長遴選的爭議，或是教育部長的決策，都沒有所謂總統默許的問題，這樣的操作無助於解決問題。」 她另也針對校長遴選過程表示，台大是台灣最高學府，理應面對社會最高標準的檢驗，監察院也已就本案提出糾正，但顯然台大校方和遴選委員會都置若罔聞。
蔡英文指出，處理台大校長的遴選爭議，當然是教育部的權責。不過，身為執政團隊一份子，教育部長僅在記者會前一小時透過簡訊告知，也未遵照行政院長賴清德指示向總統報告，就逕自宣布決策，她跟賴清德都相當錯愕，也讓許多國人感到不解，難以接受。
蔡英文說，台大校長的遴選案之所以引發社會高度爭議，關鍵就在台大校方和遴選委員會在過程中的種種瑕疵，包括：遴選委員會的企業代表，選擇企業獨立董事擔任校長，是否有利益迴避的問題？營利事業代表在國立大學校長遴選制度中所佔的比重，是否影響國立大學的自主性？以及接受遴選的候選人，擔任企業獨董的資訊是否應該事先揭露等等。
蔡英文強調，台大是台灣最高學府，理應面對社會最高標準的檢驗，監察院也已就本案提出糾正，但顯然台大校方和遴選委員會都置若罔聞。
蔡英文表示，面對大學自治，即使身為總統，對於校長的人選，也沒有置喙的餘地。但她同樣期待，大學自治應該對程序正義有所堅持。
蔡英文說，一個清楚的事實是，無論是台大校長遴選的爭議，或是教育部長的決策，都沒有所謂總統默許的問題，這樣的操作無助於解決問題。政府在處理台大校長遴選爭議過程中，確實遭遇許多困難，例如現行制度並不周全，如果沒有校方積極配合，就容易落入無止盡的僵局。對此，政府會深切反省檢討，並虛心接受各界批評。
