一位資深貨輪船長指出，兩岸間往返貨輪甚多，不免攜帶對岸肉品食材供船員食用，廚餘雖不准上岸，「但若在港口停留數日，常有船員不願把廚餘留到公海再丟，就直接拋入港口附近海中。」這位船長說明，漲退潮很容易把廚餘帶上岸，應由港務公司負責消毒，必要時協請當地縣市政府或國軍支援。
還有船員投書《報橘》指出，船員及船上垃圾可能夾帶食物上岸；涂姓貨輪船員也呼應道，船舶靠港前後應加強檢疫，船員進出關口，港警也應加強檢查，與日美澳相較，台灣過於寬鬆。另外，交通界人士也建議，為強化防疫縱深，旅客由小三通入境金馬，再搭機或乘台馬之星客輪入台，也需強化宣導作為，並善用既有Ｘ光機查驗能量，建立第二道防線加強查緝，禁止非本國肉品或絞肉等不明來源肉品入台。
交通部官員建議調派國軍人力
農委會防檢局動物檢疫組長彭明興說明，各國際機場都有焚化爐焚燒飛機餐廚餘，目前檢疫犬及關務人力確實不足，財政部關務署已研議針對隨身行李，在申報處放置Ｘ光機加強檢驗，農委會並已請增約聘僱人力。
交通部官員指出，各機場、港口在疏運高峰期增加攔查，確實可能造成大排長龍，為避免引發民怨，既然行政院已針對非洲豬瘟成立跨部會應變中心，應思考調派國軍人力，「如果非洲豬瘟不幸在台灣爆發，可能又要出動國軍撲殺，與其把國軍人力花在疫情之後，不如花在疫情之前。」這位官員指出。
