總統馬英九趕在卸任前親登太平島，週邊國家質疑台灣在南海主權的論述和中國類似，立場疑似傾向中國。馬英九28日傍晚自太平島返台後舉行記者會表示，北京繼承中華民國的南海主權，內容當然一樣。他更表示，兩岸有很多共同的歷史和血緣，例如再過一週兩岸都要過年，「我看到你說恭喜恭喜，你不能說怎麼跟大陸說的一樣？怎麼可以親共？」
登太平島為促成馬習二會 馬：想像力嘆為觀止
馬英九卸任前親登太平島之舉，引發國內外一片譁然；國內甚至有媒體傳出，馬英九此舉是為了能在卸任前促成馬習二會。馬英九28日聽到此一說法，直呼「這樣子的想像力嘆為觀止」。
馬英九連聲說明，此次完全是為了南海國際仲裁案而登島，純粹是希望太平島不要被降格，「和兩岸關係完全沒有關係，和大陸一點關係也沒有，跟習近平更沒有關係。」
有國際媒體問及，亞太地區國家質疑，兩岸對南海領土主張內容十分類似，而針對馬英九登島之行，中國更發表聲明，指兩岸華人有共同責任捍衛南海主權，是否台灣在南海議題上確實有傾向北京的趨勢？
馬：提出南海主張時 中共政府還沒出現
馬英九解釋，有關南海主張，中華民國在1947年12月1日提出，當時中共政府還沒出現，後來北京繼承國民政府的主張，「內容當然一樣」，而非我方提出一樣的主張。
但他也說明，雙方主張並非完全一致，對岸所畫的南海位置圖，還是少了兩線（中方為「九段線」）；更重要的是，他提出南海和平倡議，主張和平解決，「這是最大的不同」。
馬英九也說， 再過一個禮拜就過年，大陸也過年，從這個例子來看，台灣和中國有「很多共同歷史、共同血緣無法切開」，比方過年「我對你說恭喜恭喜，你不能說你們怎麼說得跟大陸一樣？怎麼可以親共？」
對於兩岸是否曾就馬英九登太平島一事進行溝通，陸委會新任發言人楊家駿28日下午在例行記者會表示，此舉為總統行使主權，同時宣慰當地海巡署派駐人員，是很正常的行為，事前並未和國台辦聯絡，也沒有立場去聯絡。
