前總統陳水扁9日在「新勇哥物語」中指出，新系獨大造成不少負面影響，從台南市議長選舉、台南市立委補選來看，新系都想「整碗端去」，煩惱4年後，民進黨恐怕會失去台南市的鐵綠票倉。
針對新潮流的影響力，扁指出，前行政院長林全過去曾說「有的派系在立院佔20多席，人事、政策等等，不聽他們的不行」，感到相當困擾，當時陳水扁回應「可用派系中人，但不能為派系所用」，林全卻回「人家委員那麼多，可以不聽嗎」？「只要是人才，可用派系中人，不僅是民進黨的人才，也是國家的人才，但不能為派系所用」陳水扁認為，總統、院長、首長級用人不可以在任何壓力下由派系決定或硬推人選。
陳水扁指出，黃偉哲當選台南市長後，台南市立委將進行補選，他點名前勞動部次長郭國文，是行政院長賴清德屬意的派系人選。而台南市黨部主委黃先柱卻不按照補選徵召的規則辦理，原因竟是「民進黨目前氣勢不好，所以民調不準」。
「為了顧自己派系，竟然破壞徵召的遊戲規則」，陳水扁認為，由市黨部建議民調，讓「同派系的人整碗端走」，為了某個派系，應排斥其他派系，造成現今的議長選舉結果，憂心4年後，民進黨的大本營台南市恐會失去綠色政權。
