選後新一屆國會已在1日正式就職，新政府卻必須到520才上任；3個多月期間，兩岸關係是否如選前規劃推動，存在變數。兩岸決策高層透露，我方在選前就曾邀中國國台辦主任張志軍再次訪台，選後若有適當時機，也願意再度表達邀訪之意，甚至為準執政黨「搭橋」；但此一設想能否落實，不但要徵求新國會同意，還要看北京是否願意在新政府上任前與台灣互動。
兩岸談判是否繼續 須視立法院態度
2016大選實現行政、立法權同時政黨輪替，兩岸政策方向也可能調整，然而長達百餘天的看守期卻讓總統馬英九持續推動兩岸政策的想法陷入尷尬。外界關切520前《兩岸貨貿協議》及兩岸互設辦事機構等談判是否繼續，知情兩岸官員私下坦承，「我們現在不敢講」。
官員指出，外界一直存在馬政府可能在520前強推兩岸談判的質疑，但現在連我方自己的作法是什麼、立法院是否同意繼續談都不知道，若國會堅持必須先通過《兩岸協議監督條例》，陸委會也只能先做談判準備，未獲國會同意前，不可能去談。
北京是否願和看守政府談判 我方沒把握
我方官員更指出，即使新國會同意陸委會等相關部會繼續推動兩岸談判，但北京在目前階段是否願意和即將卸任的政府談判，我方也沒有把握。
儘管即將輪替的國、民兩黨對看守期政府權限有不同看法，但知情的兩岸高層透露，陸委會不排除在520前再次主動與北京聯絡，提議陸委會主委夏立言與張志軍進行熱線通話，表達我方希望兩岸交流能持續前進的想法，同時邀請張志軍再次訪台。
陸委會願為新執政黨搭橋 「要不要得看他們」
知情官員強調，就算政黨輪替，但「兩岸間制度化的事情可以繼續往下走」，陸委會不僅有意邀請張志軍在520前再次訪台，更願意為對岸和新執政黨「搭橋」，但是「要不要還是得看他們」。
對於《兩岸貨貿協議》及互設辦事機構等議題，陸委會高層強調，兩岸協商中的議題，「在各方面都有進展」；能否延續下去，就得取決於新國會與北京對看守政府的態度而定。
