星雲法師27日在高雄巨蛋體育館舉辦「2016禪淨共修祈福法會」，副總統吳敦義與台南市長賴清德皆到場，星雲法師卻在台上大讚未到現場的高雄市長陳菊，更稱「比你（吳敦義）過去執政做得更優秀」，在近萬名信眾前「洗臉」吳敦義。
星雲法師表示，吳敦義與高雄淵源很深，也曾擔任過高雄市長，但他稱讚陳菊，比吳敦義過去執政做事範圍更廣，而且做得更優秀，星雲也感謝高雄市府對於佛光山的幫助。星雲也稱讚賴清德在台南大地震的救災表現，直言他是有能力、魄力以外，還很有慈悲心，令人敬重的一位市長。
陳菊28日上午接受訪問時回應，「沒有一個市長可以做到100分」，指高雄縣市合併後，土地面積是過去的18倍、人口增加120萬，確實比過去的市長們承擔更多壓力，也覺得時任市長吳敦義，有心想把高雄市做好，只是時空和環境不同。她也感謝星雲法師看到市府的努力，並認為「市政成績是市民共享，盼沒有藍綠和族群之分」。
