行政院改組後，總統蔡英文積極構思總統府及國安團隊補強。據透露，前總統陳水扁時代，游錫堃任行政院長時重用的新聞局長葉國興，將擔任蔡政府的國安會副秘書長，接替蔡英文非常倚重的陳俊麟職務，但陳仍留在國安會團隊內，將轉任諮詢委員。另外，甫卸任行政院副院長的施俊吉也將出任國安會諮詢委員。
台灣主體意識強烈的葉國興，曾在扁政府時期擔任新聞局長、政務委員與行政院秘書長等職務，深受游錫堃重用。葉國興也力挺游錫堃爭取2008年爭取黨內總統提名，但最後在初選失利。
民進黨2008年下野後，一度仍參與黨內運作的葉國興，還曾參與選戰策略小組，但在民進黨中執會於2009年通過徵召李俊毅參選台南縣縣長，而非提名當時陳水扁屬意的陳唐山，他以「與他對民進黨選戰策略小組成立宗旨的認知不符」表示退出民進黨選戰策略小組，不再參與該小組事務，而後葉國興也淡出黨內政治。
深受蔡重用 正港秘書長是他
陳俊麟深受蔡英文倚重，在這2年多來，是蔡政府國安事務樞紐，尤其當前外長李大維轉任國安會秘書長職務，但黨內外都認知，任國安會副秘書長的陳俊麟，才是「正港秘書長」。此次總統府與國安團隊補強，陳俊麟雖讓出需扮演「總其成」角色的副秘書長職位給葉國興，但仍在國安會內任諮委。而身為蔡英文核心幕僚，陳俊麟在蔡英文要爭取連任的大選年，角色將單純化，就是幫蔡拚連任。
對於施俊吉出任國安會諮詢委員，總統府發言人黃重諺表示，施俊吉學養俱佳，政務歷練完整，對於國家財經情勢與整體發展，更有通盤的了解，實務經驗豐富。蔡英文希望借重施俊吉的知識與經驗，充分掌握美中貿易衝突下的各種可能挑戰，並提出有效因應策略，因此特聘其為國家安全會議諮詢委員。
