因此當時，同性戀被列在精神疾病統計診斷手冊（DSM-II）的「社會病態人格疾患」。這個意義幾乎等同於，「官方認為同志是一種病」。
但同志的悲慘命運並不是到此為止。1962年大型精神分析研究又將同性戀視為「親子關係的受創而導致的精神疾病」，把這樣的說法推上高峰，在這個當下，在醫界他們被認為是「病」，在宗教上被某些教派認為是「惡」，在許多國家法律中被認為是「罪」。
愛看電影的朋友如果看過「模仿遊戲」，可能就有印象，片中拯救世界結束大戰的英國天才科學家圖靈，就是因為同性戀行為被迫害致死。
圖靈在1950年發表《電腦與智慧》（Computing Machinery and Intelligence）論文，是開啟人工智慧的曠世天才。二戰時他協助英國軍方破解德國著名密碼機「Enigma」，這項功績估計讓二次大戰至少提早2到4年結束、挽救估計4000萬人性命。但他卻因為同志身份遭到迫害，自始在歷史上宛若不存在這個人。一直到 2013 年在數萬人民的請願下，英國女王才正式「赦免」他的罪。
而大家可以想想，世界上曾有多少優秀的人，只因為他的性傾向，或其他根本無涉公眾利益，但不見容於社會的行為，就悲慘地度過一生。
也在這樣的「同志是疾病」的錯誤認知下，當年有些醫師就施行過各種「轉化治療」，試圖「矯正」同志的性傾向。包含電擊治療、厭惡治療（看同性戀色情刊物病並聞氨水催吐造成厭惡感）、精神藥物治療、催眠等等。
這在現在看來，都是可怕且毫不人道的作為。而這些治療方式，在離我們很近的中國，就仍持續發生中。
但黑暗中，知識份子的堅持，仍然照亮了一絲光明。1957年美國心理學家Evelyn Hooker，針對男同志的心理調適做研究，根本的質疑是：「同性戀本身是不是心理疾病？」
她各找了相同年紀、智商與教育程度的同性戀和異性戀男性，做了各種心理適應測驗，結果發現「沒有顯著差異」。
因此這個實驗證明了兩件事情：
同性戀診斷在臨床上完全不存在，其形式多樣和異性戀類似。
同性性傾向是性形式的一種，屬正常的心理。
而在之後，一波又一波的實證研究，以及醫界自身檢討力量與外界質疑中，醫界展現了自我檢討的能力，回歸醫學最基礎的「科學」與「邏輯」，以「實證」依據和「人道」精神重新評估並理解人類的多元性傾向。
美國精神醫學學會終於在1973年，將同性戀從其官方疾病診斷手冊上移除。世界衛生組織也進行類似的科學審查程序，於1990年將同性戀從國際疾病傷害及死因分類標準中刪除。泛美衛生組織也發出聲明：「基於同性戀沒有任何明顯跡象可被認為是一種病症或疾病，因此無需治療。」
