勁敵成知音 共創新佈局
當時中日關係很緊張，靠著日本親中官員的支持，吳清源才能如願14歲赴日。為了檢定棋力，日本棋院安排測試棋局，讓他對戰當年棋壇霸主「名人」秀哉（讓２子）、以及3個四段棋士，終以4勝成績取得三段資格。之後雖因肺病休養一年，但在師父瀨越指導下，吳清源剛滿18歲就取得五段資格。
有段時間，吳清源下棋總是贏不了年長5歲的同段棋士木谷實。他們的個性、棋風南轅北轍，吳直覺強大，下棋節奏快速，木谷習慣細算所有可能，慢慢歸納最好的一著。
兩人唯二共通點，就是對圍棋單純而熱烈的心志；以及牴觸傳統的佈局想法。
新佈局：圍棋盤上的初次解放
當時日本圍棋有很多不成文規定──通稱為「定式」，比如說前幾手應該下在棋盤四角的８處位置（參考下圖），才容易佔牢4角空地。
一般認定，若開始就往中間區域下，防守難度比較高；反之，若太靠近4邊或4角，棋子容易被對手壓制。所以，不下「定式」的人，會被當成大外行、不受教、甚至不禮貌。偏偏中國來的吳清源，很不喜歡那個傳統；土生土長的木谷實也覺得，傳統定式不利於白棋。
木谷思索的新佈局，是把前幾手棋靠中間下，像是連3手下在星位（上圖星星標示處），稱為「三連星」。吳清源想到的新佈局，則是先下在「三三、星位、天元」，就是上圖標示火柴、星星、太陽的位置；兩人相互討論後，開始套用到正式對局，輸了幾場才漸入佳境。
這種大膽嘗試後來出書《新布石法》，讀者反應熱烈，業餘圍棋界先流行起來，慢慢擴散到職業圍棋。1933年吳清源再次挑戰「名人」秀哉，他赴日後多次與這位棋壇霸主對奕，從來沒有輸過，只過段位較高的秀哉每次都讓吳清源2個黑子，輸棋不算丟臉。
本因坊掌門人遭「鬼門打」
1933年這場棋秀哉沒讓半顆子，只是由吳清源持黑，堪稱中日高手對決，「名人」無論如何輸不起這盤棋。10月16日開局，吳清源前3手就下「三三、星位、天元」，馬上引發輿論爭議，問題還是出在日本圍棋界的不成文規定。
「三三」從江戶時代開始，就是日本圍棋界的禁忌位置，被稱為「鬼門」，那裡落子就稱為「鬼門打」，後果非常嚴重，甚至會被逐出師們。雖然沒人說得清楚原因，本因坊非常堅持，下「三三」就是對長者的不敬。對本因坊掌門人下「三三」，吳清源的舉動簡直藐視日本棋壇。
參考當年棋譜（上圖左），持黑棋的吳清源最前面幾手，就下在三三、星位、天元的位置；持白棋的秀哉前３手只下定式，棋路壁壘分明。《讀賣新聞》刊出棋譜後，數不清的民眾寫信去抗議，爭議有助於報紙銷量，《讀賣》也拜吳清源之賜，從地方小報慢慢拓展成全國第一大報。
