馬英九總統28日上午再就我國漁船在沖之鳥礁附近海域遭日本公務船扣押一事發表看法，除譴責日方嚴重違反聯合國《海洋法公約》確立的「公海自由」外，並強調「基本權益，不能退讓」，他已要求海巡署等相關單位儘速派艦護漁。而我國外交部長林永樂也將於29日上午召見日本駐台代表，表達我國嚴正立場。
我國漁船在日本沖之鳥礁附近海域捕魚遭扣，雖然漁船已在繳交訴訟保證金後獲釋，但我國政府主張沖之鳥礁無權主張200海浬專屬經濟區的主張，馬英九已於27日國安高層會議中要求海巡署及漁業署派出船艦護漁。
馬英九28日上午接見「菲華文經總會」回國致敬團時，再度對此議題表達立場。馬英九強調，沖之鳥礁不到3坪，日本透過人工擴建為好幾百平方公尺，並主張200海浬專屬經濟區，此舉違背國際法。
馬英九強調，沖之鳥是礁，「這麼小、不能住人」，實際上也沒有住人，不可能有水、不可能有可供生活的設施，但日本說它是個島，而且在200海浬內抓我國漁船，這非常嚴重地違反了聯合國《海洋法公約》第87條所確定的航行、飛越、捕魚等6大「公海自由」。
馬英九認為，沖之鳥礁應該只有500公尺的安全區，日本居然主張200海浬經濟海域，扣押我國漁船並罰款187萬台幣、繳錢才能放人，令人感覺到非常不合理；因此他召開國安高層會議，宣示捍衛公海自由、反對日本擴權違法，希望能有效保護漁民在公海作業自由。
馬英九表示，他已要求海巡署相關單位，儘速派艦艇到附近護漁，「這是基本權益，不能退讓」；外交部也將繼續協商強力交涉，盼真正贏得國際社會尊敬。
