陳水扁執政時為了解決朝小野大的困境，遂修改黨章，讓總統得兼任黨主席，希望藉由「以黨輔政」的方式爭取民進黨的政治資本。2016年大選後，蔡英文雖然循著陳水扁的彼時慣例兼任民進黨主席，但是時空背景顯然有了很大的差異，這使得蔡英文的政治動機頗值得玩味。
首先是為了建立有效的「以黨領政」的協調功能。民進黨雖然已經達成完全執政的政治目標，但是面對包括國際、兩岸、內政各方的挑戰，為了減少府院黨之間的溝通成本，讓政務與政策有效的推動，以黨作為中間的潤滑轉換應是最有彈性的作法。 蔡英文已恢復扁時期每周一晚上於行政院舉辦「行政立法協調會報」，作為政策溝通平台，府、院、黨及黨團幹部皆會派代表出席，此一機制將與蔡英文週三所主持的中常會互為補充。相關機制多少可避免先前個別立委鬧場、擦槍走火、違背政治立場的突發狀況。
由於蔡英文每週只主持中常會，例行的性的黨務、組織與文宣的運作皆由秘書長所規劃，應此也可視為「準秘書長制」，擅長組織協調的洪耀福將扮演重要角色。
其次是派系平衡的考量。國民黨執政時期的馬王政爭之問題，將不會發生在民進黨身上，因為除蔡英文個人領導風格外，嫡系英系立委扮演穿針引線的功能，以及黨內派系平衡的生態也是重要關鍵，這可在協調柯建銘退出立法院長選舉過程中得到充分解釋。但和國民黨抬面下宮廷鬥爭有所不同，民進黨派系之間的競爭則是政治常態，此一現象將在未來地方縣市長選舉中日漸白熱化；這包括了因為政治合作關係可能生變的台北市，以及因任期結束的台南與高雄等幾個重要指標市長的提名權之爭。處理這些問題，不外是進行協調以及辦理公正的初選，惟有憑藉蔡英文的聲望與高度才能將政爭的衝擊降到最少。
值得觀察的是，為了維繫現階段的黨內派系的權力平衡，黨中央所發佈的新人事直接反應上述事實：除了組織系統出身的高幸雪以外，另兩位副秘書長李俊毅與徐佳青剛好平衡了謝系與新系之間的關係；新聞部主任孟義超具有游系色彩，留任的媒創中心主任李厚慶長久以來則是蘇係大將。外界所關注的國際事務部與中國事務部則由英與謝系立委羅致政與趙天麟兼任。這些人事的意義，充分說明了民進黨的政治性格。
最後，蔡英文決定由邱義仁執掌民進黨智庫更有深邃的戰略考量。新境界文教基金本為民進黨扮演白手套之雞肋角色，所以轉型成為智庫內涵，實為蔡英文在2012年敗選之後，運用中選會的選票補助款建置而來，因此蔡英文可謂是民黨智庫的催生者，智庫也在邁向執政過程中扮演政策研究設計的功能。
按北京的觀點，由於蔡英文政府目前「尚未答好考卷」，使得兩岸的官方與兩會交流處於中斷階段，但基於建立溝通管道的主客觀的需要，加上民進黨過去始終希冀智庫扮演「二軌對話」的角色，使其協調地方執政縣市的兩岸事務小組，推動「由下而上」的交流模式，若再加上未來與美日進行的各項戰略對話，具備國安背景同視野兼任亞東關係協會會長的邱義仁，應為此一人事任命的主要考量。但兩岸目前欠缺政治互信的基礎，因此所謂二軌交流尚難以得到北京的回應與認可，主導權自然不在民進黨手中。
＊作者為兩岸政策協會研究員
