教育部認為其中「校長解聘要件」有違反《私校法》之虞，立即去函要求董事會修正。教育部高教司長李彥儀駁斥，教育部從來沒有主動要求私校訂校長監督辦法，認為訂定考核辦法由各校決定。
校方、董事會BOT利益相衝 校長：過度干預校務運作
任職高醫大校長迄今4年的劉景寬更罕見在校方官網發表聲明，譴責這項辦法將「斲傷董事會與校方之互信、過度干預校務之運作、越線侵犯學術尊嚴」，事前未曾知會，也極度不尊重大學自主與學術自由，用意在於箝制高醫大校長、干預高醫校務，已嚴重危害高醫大聲譽與學術尊嚴。
校方認為，董事會在岡山醫院BOT案與校方的利益分配衝突，因此想盡速透過訂定校長監督辦法插手。高醫取得BOT案後，預計投資約40億元興建岡山醫院及長照附設機構。
學生發起「透明革命」 籲求解散董事會
高醫大學生會4月17日也與包括醫學系在內的9個系學會發出共同聲明，並提出立即公開「校長監督及考核辦法」全條文及「財務透明化」等6項訴求。高醫大師生至此發起「透明革命」（透革，Talk），並於5月24日衝進董事會現場抗議，要求解散董事會並由教育部接管。
立委陳其邁、管碧玲、陳宜民也於6月3日出席透明革命逗點晚會（Coma night），副總統陳建仁及監察院長張博雅也陸續接受學生呈遞陳情書，包括董事候選人提名，須由教育部協助組成遴選委員會篩選投票等訴求。
教師無懼支持連署 開出私校改革第一槍
此外，活躍於產官學界的高醫校友，也在6月5日於高雄美麗島站內的美麗島學院，成立「高醫轉型正義促進會」，由前總統府國策顧問、台灣醫界聯盟基金會董事長吳樹民、人權醫師陳永興、高雄長庚醫院榮譽副院長陳順勝擔任籌備會共同召集人，進行高醫的轉型正義調查報告。其他高醫校友也呼籲高醫醫護人員，在寫經歷時把「中和」拿掉，要紀念也是寫「聰明」。
高醫大性別所教授成令方9日表示，目前已有全校3分之1老師超過150位加入「透明革命-解散高醫董事會」的連署，共收到1千多份連署書。對於有老師擔心遭秋後算帳，成令方表示，近年教師升等越來越清楚，申請國科會、科技部計畫也很公平，根本毋須擔心。
彰化醫界聯盟理事長蔡志宏指出，私校法改革是全國性議題，期盼高醫改革能點燃全國私校改革第一槍，包括校務透明化、董事會體制規範、教育部依法審核、保障私校師生代表出席的權益。
