五月七日立院在民進黨團主導下，三讀通過《國家機密保護法》修正案，將卸任官員出境管制期限，由原本的三年延為最長六年。十七日總統府趕在五二○的三年境管屆滿前，發出公文通知前正副總統馬英九、吳敦義將再延長兩年境管，馬、吳今年原規畫出訪對岸，確定無法成行。
由於府方公文並未提及延長境管的理由，加上在境管期限失效前兩天才倉促知會，惹怒馬、吳十九日聯袂召開記者會，痛批總統蔡英文出於政治考量「因人設事」，採取「羞辱性」的行政處分，馬、吳不但要求蔡英文親自說明延管原因，也將向總統府提出申復。
據瞭解，蔡政府主要針對馬、吳延長境管，前總統府秘書長曾永權以降前朝官員，多數在五二○後已自動解除管制。由於吳敦義原排定六月中旬率團到對岸出席國共論壇，並前往北京與中共總書記習近平會面，他在府方發出延長境管公文同時，也向總統府遞件申請登陸，如今黨中央已有國共論壇被迫停辦的最壞準備。
雖然總統府仍強調，對於涉密程度極高的重要人員，如卸任總統、副總統適度延長境管，符合法律規範及比例原則。但有藍營高層透露，國民黨所掌握綠營內部訊息，蔡英文最怕的是馬英九登陸效應，她對吳敦義訪中其實沒那麼在意，但若只管制馬卻放過機密等級相同的吳，將很難對外自圓其說，「吳敦義只是連帶受累」。
這位高層指出，馬英九訪中必進行「馬習二會」，將引發兩岸及國際高度關注，萬一習藉機釋出對台利多或修正「九二共識」的說法，將直接衝擊蔡英文主打的「反中牌」，不利明年總統大選選情。
一位熟悉兩岸事務的藍營人士也說，對岸民間對馬英九頗有好感，他登陸掀起的歡迎熱度，很可能更勝二○○五年到中國的「連爺爺」，「平白送門炮給馬英九，又凸顯自己在兩岸事務上的困窘，蔡英文絕不會幹這種蠢事！」
