即使在一六年，民進黨小英總統上台，還是得執行馬政府任內經立法院通過的高鐵財務改造方案，也就是要減資六○％，同時再增資三百億元，五大原始股東不能參與增資，政府變成最大股東，原始股東退出經營權。
高鐵從面臨破產變成大賺的關鍵，就在於政府願不願意放寬「特許期」。在民股當家時代，即使殷琪當時不斷遊說，政府就是不願意放寬特許期，使得原先短短三十五年的特許期間，必須認列龐大的折舊攤提，是造成高鐵嚴重虧損的重要原因，但從一六年收歸國有後，政府就同意特許期延長三十五年變成七十年，高鐵財務因而獲得紓解。
雖然五大股東被迫降低持股，但政府還是有「彌補」，全都拿回特別股本金與股息，也返還站區開發權的回饋金、退回仲裁案，雖然這些做法沒有令五大股東都滿意，但也不無小補。
東元躍升為最大民股股東
五大創始股東中，大陸工程與長榮都逐漸出清持股，漸漸淡出經營權，唯獨手中一張高鐵股票都沒賣的就屬東元集團了。東元即使歷經過財改，但還持有三．三八％、約十九萬張的高鐵股票，躍升為最大的民股股東，今年還領到二．一億元的現金。此外，富邦集團的台灣固網也還持有一．六％、國泰世華銀行也有一．四九％的股權，高鐵如今翻身成了金雞母。
事實上，高鐵不僅已成為台灣人不可或缺的交通工具，也一掃過去的形象，五大股東沒有功勞也有苦勞。
