香港警察20日傍晚突然對九龍清真寺發射藍色水砲，由於附近當時完全沒有抗爭活動，但港警卻對清真寺與經過民眾三度發射藍色水砲，引發輿論不滿。香港特首林鄭月娥21日親自登門致歉，清真寺首席教長穆罕默德・阿夏德（Muhammad Arshad）雖表示「相信只是誤會」，但被藍色水砲擊中的香港印度協會前主席毛漢（Mohan Chugani）表示，警察根本就是故意的，他原來很相信香港警察，「現在我一點也不相信了」。
香港警察20日傍晚在彌敦道多次朝示威者發射藍色水砲，道路兩旁多棟建築物也遭到波及，其中竟然也包括香港規模最大的清真寺—九龍清真寺。根據網路上流傳的多支影片可以清楚看到，九龍清真寺內外當時都很寧靜，完全沒有任何抗議活動，但開著水砲車的港警卻突然對清真寺發射水砲。除了一般市民之外，包括公民黨立法會議員譚文豪、香港印度協會前主席毛漢也都被射中。毛漢因為身體不適、馬上被送醫治療，幸無大礙。
This is the moment the Hong Kong Police Force fired the water cannon at Kowloon Mosque.
— J P (@hyjpang) October 20, 2019
The water cannon is only supposed to be used to disperse large crowds. But apart from those worshipping/a few people guarding the mosque, there was no one there. #HongKongProtests pic.twitter.com/sXEEAV7GLK
73歲的毛漢21日回到清真寺現場，對一湧而上的媒體表示，他當時就在清真寺外跟朋友聊天，「他們根本不管，亂射一通」、「我們不是示威者，站在清真寺門口也要被射」。毛漢說：「幸好當時有人幫我清洗，（否則）整個人都腫了，自己都看不清自己的樣子。」這位原來支持香港警察的香港印度協會前主席還批評：「香港政府、警方真的很離譜」、「原來我很相信香港警察，但現在我一點都不相信他們了。」
Protesters are cleaning up Kowloon Mosque. They are more responsible than Hong Kong police. pic.twitter.com/olgaqG2RCf
— JW (@thejediwalker) October 20, 2019
事發後，用來染色抗爭者的顏料，把清真寺的大門跟階梯全都染藍，但許多香港民眾自發協助清理，香港警方20日晚間則透過社群媒體澄清，表示當時是在驅離示威者時，「不小心」用藍色水柱誤擊九龍清真寺正門與附近民眾。港警強調：「一直以來，警隊與九龍清真寺及在港的穆斯林社群保持良好關係。 警方絕對尊重宗教自由及會盡一切能力保護所有宗教建築物。 」但毛漢表示，香港警察根本就是故意的，「沒有想到香港警察會這樣對待一個年長的市民，我覺得香港現在已經沒有王法了」。
巴基斯坦裔的香港商人簡浩名（Phillip Khan）當時也被藍色水砲射中，他表示：「我們不是搞事分子，搞事分子應該是警察，不是其他人。」對於清真寺遭受攻擊，簡浩名更批評「警方簡直在挑戰伊斯蘭教，不懂什麼是尊重他人的宗教」。簡浩名說，《基本法》有保障人的宗教自由，不過，「警方一點尊重都沒有」。
在九龍清真寺外，菲利普·汗（Philip Khan）強烈譴責香港警察和林鄭月娥，稱政府通過使用水槍向清真寺噴藍色染料來侮辱伊斯蘭 https://t.co/S72NXxpEyR
— (@Fight4Veritas) October 20, 2019
香港特首林鄭月娥、警務處處長盧偉聰等人，21日中午親赴九龍清真寺道歉致意。林鄭身穿白色套裝配一條白色絲巾，進入清真寺逗留約25分鐘、不過沒有到一度被染藍的大門與階梯等地逗留，她在離開時並未對媒體發表談話。陪同林鄭視察清真寺的穆斯林代表事後發言，表示林鄭與警察都來真誠道歉、強調是「無心之過」，他們也接受了。
清真寺首席教長穆罕默德・阿夏德說，前一天清真寺外並沒有暴力事件，相信這次事件只是誤會。穆斯林代表也感謝幫忙清潔的香港市民，還說「香港是我們的家，清真寺沒有受損，沒有事情做錯」（Hong Kong is our home. Mosque is not damage. Nothing is done wrong.）。當媒體提問這起事件是否讓他們對香港改觀，教長連聲說「不」，重申「感謝所有人」。
