中國政府先前就放出風聲，稱民進黨政府上台後台灣的外交、兩岸交流可能生變。
6月：銅鑼灣書店店長林榮基爆料
早於2015年11月曝光的銅鑼灣書店事件於這個月份出現突破性發展。一度被中國不明部門拘留的店長林榮基6月16日突然召開新聞發佈會，披露自己被所謂的「中央專案組」帶走。
他在接受BBC專訪時描述了在他被帶離香港之前如何被有關人員跟蹤。
中國外交部駁斥林容基言論，稱辦案單位為浙江寧波警方；中共《人民日報》旗下《環球時報》連續發文批評香港從未向大陸移交犯罪嫌疑人，港府繼而與北京展開磋商。
銅鑼灣書店事件實際上成為了2016年纏繞中英關係的主要事件之一。1月份，時任英國外相哈蒙德訪華時與中國外長王毅公開交鋒，王毅評論涉案書店股東李波的一句「首先是中國公民」引起香港廣泛議論。
倫敦外交部其後在提交議會的《香港半年報告》中批評李波事件「嚴重違反」1984年《中英聯合聲明》，李波繼而現身香港鳳凰衛視，宣稱將放棄透過「居英權計劃」取得的英國公民身份。
7月：「南海仲裁案」
荷蘭海牙常設仲裁法院宣佈，中國聲稱擁有南海主權的歷史證據以及所劃定的「九段線」地圖沒有法律依據。仲裁結果對中國不利，中國採取「不接受、不參與和不承認」的態度。
隨後中國的互聯網上掀起一片愛國熱潮，甚至抵制菲律賓芒果和美國肯德基的聲音。
三個月後，菲律賓總統杜特爾特變身「首席和事佬」訪華，並對中國的國家媒體表示： 「為一片水域而起刀兵，毫不足取。」隨後中國取消對菲律賓一些農產品的進口禁令。
8月：里約奧運
巴西里約奧運會，中國隊所得金牌數被英國超越，落至第三。雖然表現不如預期，且游泳選手孫楊陷入「禁藥」疑雲，但女排睽違12年再度奪金、以生動表情說出用了「洪荒之力」游泳的傅園慧、羽球男單李宗偉與林丹激戰最後敗於諶龍，都是難忘的激動時刻。
台灣（中華台北）隊以舉重選手許淑淨奪一金，射箭、舉重拿下二面銅牌。
9月：烏坎村長「受賄遭判刑」
8日，由村民「民主直選」選出的中國廣東汕尾陸豐烏坎村村長林祖戀（又名林祖鑾）被控受賄，被判監禁三年零一個月。
林祖戀是2011年烏坎村民為土地維權抗爭的領袖，其後村民投票選出村委會，林祖戀當選村委會主任。2016年6月林祖戀被當局帶走，村民連續80多天舉行遊行，要求釋放林祖戀。
9月13日凌晨，防暴警察攻入烏坎村，抓捕十多名「涉嫌聚眾擾亂公共場所秩序、交通秩序等犯罪」的烏坎村民，村民形容官方這次是「瘋狂打壓」。
烏坎村體現出「中國基層民主的可能性」生長與衰落的過程。
