在議場的國民黨籍立法委員賴士葆則在臉書上形容，在議場時是「懷著悲壯的心情」，看著反滲透法如坦克壓境強行通過。他抨擊「滲透」的定義模糊，執政者認為違法就是違法。「時間倉促、沒有充分討論、缺少對話，違背程序正義，台灣跟北韓（朝鮮）有什麼不同？」
另一位當時在議場的國民黨籍立委黃昭順則形容這是「台灣民主蒙羞的一天」，讓老百姓不敢放言高論、暢所欲言，台灣將「退回戒嚴時代的驚恐氛圍」。
對於該法0票反對獲得通過，民進黨籍的蔡適應說：「國民黨內部也是很多討論跟矛盾，主張應該新一期的國會選出再來訂等。但他們出席人數沒有過半，除了代表很多都不願表態外，另一種層面也是代表反滲透法就是大家的共識，知道有其必要性。」
中國批評綠色恐怖
《反滲透法》通過後，中國國台辦在第一時間表達嚴重抗議，國台辦發言人朱鳳蓮稱「民進黨政府為選舉私利，違背民意所向而大搞綠色恐怖」。
國民黨籍立委馬文君則表示，台灣民主的可貴，就在於堅守言論自由、新聞自由、宗教信仰自由等等。她認為反滲透法不只倉促成案，更凌駕憲法保障人的自由權，「變相的將台灣人民預先分類並貼上標籤，既可怕又可惡」。
而民進黨籍立委蔡適應則認為「這完全跟戒嚴沒關係」。他解釋，戒嚴是全面性地軍事管制，包含意識形態也管、生活方式受限、集會遊行都不允許，但《反滲透法》完全沒有規範到這類行為。
被疑滲透台灣的五類行為
- 成立網軍：利用臉書成立粉絲專業、台灣的BBS等收購多個賬號，來攻擊特定人士。或是煽動網絡謠言，在台灣媒體尚未查明真相前大肆渲染，達到台灣內部意見不一，社會不安與混亂。
- 收買基層：深入台灣各大寺廟，還有農林水利漁會等組織。以招待旅遊的名義到中國大陸參訪，與統戰部及國台辦人士接觸，宣傳兩岸一家親的概念。
- 海外資金：全力支持特定政黨候選人，從第三國等管道匯入大筆資金，大量捐款給特定人士。日前台灣官方才於台灣南部抓到兩岸地下匯兌，經手金額多達139億台幣（約4.65億美金）。
- 贊助媒體：成立多個新媒體與網絡公司，大量製作「農場新聞」，在未經查核前便四處散播。另外贊助地下電台與報紙，讓他們報導對中國官方有利的新聞，試圖影響地方政治運作。
- 進軍政治：扶持親中的人士參與政治，以地方縣市議員為目標、中期進軍立法院擔任立法委員，最終目的是讓親中國的候選人將來有機會角逐總統。另外也透過其他管道與台灣的親中政黨持續密切合作。
