雖然「過去沒有主管機關在負責保防情報」，不過，眼下各機關內設有政風單位，政風一條鞭的體質也得以貫徹保防工作，新政府上台後，為何不由政風單位執行，卻由調查局出面？蔡清祥表示，政風目前是做公務員的反貪瀆工作，調查局原希望保防工作由政風單位來做，但主管的法務部廉政署對此則有所保留，一方面是分工考量，另一方面也或許是因為好不容易才走出一般民眾認知的「政治偵防」領域，不想再引發不快的聯想。
「美、日、德等民主大國無不致力於保防」
從機關間的抗拒就可以看出，在台灣特殊的歷史背景下，要推動「保防」工作確實有阻力，在調查局看來，「反情報」工作是理所當然，但國人直覺上卻可能認為是大開「倒車」，因此，「保防」觀念的轉換，是調查局工作的首要之務。
蔡清祥也指出，美、日、德等世界民主大國無不致力於保防。他坦言，不要帶給大家回到過去保密防諜時代的恐懼，是調查局要去面對的工作，「當年的害怕，是怕被扣罪名、叫去喝咖啡，現在有法治後，會經過法院公開審理」，同時，既有了法治，國安「這道防線要先堵起來」。
至於保防專法三讀通過，具體可以落實到什麼程度？蔡清祥說明，負責保防的人就會是一群專責人員，受過完整訓練，有相關經費，蒐集相關資料，現在對於可疑人等沒有辦法訪談查證，引用《刑法》與《社會秩序維護法》搜查，人家會稱沒有犯法而不接受約談，但保防專法通過後，在一定的構成要件下，就可以找來查證訪談、查看身分證，甚至查扣等，可以做成哪些程序就很明確了，拒絕訪查可處罰鍰，也有造成生命財產損失的權利救濟條款，甚至將來要有上級及外部監督機制。
保防專法 下會期將送入立院審查
對於民進黨政府與對岸關係急凍的此刻，推出保防專法是否予人有針對性之感？蔡清祥表示，「那你說什麼時候才是真正提出來的時機呢？」「好的時候還是不好的時候提出來？怎麼考慮都有疑慮，但該提出來就是該提出來，我們的防範重點是自己的國人，重點在國人的觀念警覺」。
他強調，調查局是參考包括英、美、德國等8個國家的反情報工作法來訂定台灣保防法，「我們有實務經驗，也請了學者先做專案研究，辦論壇邀請學者參與，草案擬出後邀相關單位討論，我也當過檢察司司長，刑法的修正也曾參與」。
目前，該法條已送交行政院會，由政務委員林美珠審查中，下一個立法會期將排入議程審查，目標是希望能在一個會期內通過，蔡說，開議後就要趕快說明，「我們有目標，有時程，行政院重視」，蔡清祥明白表示，保防工作將是調查局繼破獲史上最大宗古柯鹼案後的下一個政策重點。
