3日停靠橫濱港的「鑽石公主號」郵輪，船上已出現62例（其中1人在香港下船）武漢肺炎確診病例，嚴重衝擊日本防疫體系。由於目前仍有船上載有發燒乘客的郵輪準備靠港，日本首相安倍晉三6日晚間決定，拒絕載有疑似病例的郵輪靠岸，並且強烈邀求香港的「威士特丹號」不可停靠橫濱、立即返回香港母港。
目前還在橫濱港的「鑽石公主號」郵輪，船上3千6百多人乘客與船員還在原船進行14天的隔離觀察。由於1名在香港下船的80多歲男性，後來在香港確診感染2019新型冠狀病毒，日本政府在「鑽石公主號」2月3日回到出發地橫濱後，立即對船上3711人量測體溫，並對273名高風險乘員（身體不適、與確診病患曾有接觸者）採集檢體，共花4天才確定其中61人染病。
船上有38人出現症狀的「威士特丹」
「鑽石公主號」郵輪帶給日本的防疫體系極大壓力，也讓日本的確診人數從25人暴增為86人（但厚生勞動省主張該船患者不計入日本確診）。問題是，造訪日本港口的郵輪當然不只「鑽石公主」，2月1日才從香港出發的「威士特丹號」郵輪目前已傳出至少38人身體不適，而且預計8日停靠那霸港，日本首相安倍晉三6日晚間對此緊急召開會議因應。
這場新型冠狀病毒感染症對策總部會議在首相官邸舉行，安倍內閣的全體閣僚也都到場。由於郵輪乘員處於相對容易密切接觸的狀態，日本政府基於《出入境管理及難民認定法》拒絕乘員入境，這項決定將在7日零時生效。日方也強烈要求「威士特丹號」不准靠岸，即刻返回出發地香港。安倍還明確作出指示，往後遇到跟「威士特丹號」相同的狀況（船上有武漢肺炎疑似病例），將同樣做出明快處置。
目前「威士特丹號」（Westerdam）船上其實有5名日本乘員，日本政府希望他們能夠在抵達香港後轉搭飛機入境，並且也會提供相應的協助。國土交通省表示，該船共有乘客1455人、船員802人，其中4名乘客與1名船員是日本人。雖然日方已經將拒絕船隻靠岸的消息通知「威士特丹號」，但根據網上公開的船舶自動識別系統（AIS）資料，這艘郵輪輪在7日下午仍在沖繩石垣島附近海域，朝原定目標航行，並且回覆「仍在討論應對措施」。
在沖繩外海繞圈的「寶瓶星」
除了「威士特丹號」之外，以基隆港為母港的麗星郵輪「寶瓶星號」因船上40多人有中國旅遊史，4日出發後原本要停靠日本那霸，但遲遲等不到日本政府批准入境許可，只得在那霸外海繞圈。原本衛福部長陳時中6日宣布「國際郵輪禁止靠我國港口」，載有1709名台灣旅客的「寶瓶星號」險成國際孤兒。
