台灣武漢肺炎（新冠肺炎）疫情尚在控制之中，但包括義大利、菲律賓、模里西斯，都曾將台灣視為中港澳疫區，暫停台灣民眾入境，行政院發言人Kolas Yotaka表示，目前拒絕台灣民眾入境的國家，有些國家檯面上的理由是遵守「一中原則」，但有些國家拒絕國人入境根本原因，在於台灣民眾持「台胞證」入境中國，導致其他國家無法從我國護照，判斷國人是否有中港澳旅遊史，基於防疫考量，因此將拒絕台灣民眾入境，為避免其他國家日後採取相同措施，行政院已召開跨部會會議，討論如何在護照中，註記中港澳旅遊史。
《自由時報》今（20）日報導，武漢肺炎疫情蔓延，台灣無端受到中港澳旅遊禁令影響，飛往越南、菲律賓的航班一度遭禁，菲國祭出禁令的理由之一，便是我國護照上無法辨識往來中國的紀錄，為了避免類似情況再度發生，民進黨立委王定宇呼籲政府，將台胞證之中國旅遊史，相關資料併入護照，避免兩岸特殊關係成為國際防疫、反恐漏洞。
除了國人持台灣護照，其他國家難以辨識國人過去中港澳旅遊史問題之外，在政府宣布對所有過去14天有中港澳旅遊史之本國與外國民眾，入境後強制要求居家隔離等措施，外界開始擔心，部分持有雙重國籍之國人，以及中港澳民眾，為了規避居家隔離措施，可能持第三國護照入境。
Kolas，對於上述問題，行政院內部過去都曾經討論過，目前也在研議解決方案，為了避免其他國家，以台灣護照無法顯示中港澳旅遊史為由，拒絕國人入境情況再度發生，相關部會包括內政部、外交部、陸委會等單位，已進行跨部會討論，不過，如何在中華民國護照上，顯示國人過去中港澳旅遊史，還涉及到台灣與其他國家之間的資訊交換，因此，還需要進一步討論。
