一場突如其來的新冠肺炎，改變了各國政府的政策優先次序，一些本屬檯面上的問題，現在都暫時退居幕後。在臺灣，有人建議把防疫工作升高到國安層級；在對岸，習近平把新冠肺炎視為中共建政以來最嚴重的公共衛生事件。但疫情總會過去（希望如此），而令人擔憂的是，潛藏兩岸關係的許多老問題，因受「病毒」影響，已質變為新的問題，並形成「後疫情時期」兩岸執政當局面臨的重大挑戰。
數個月前的臺灣總統大選期間，有人認為若蔡英文勝選連任，兩岸關係可能出現「地動山搖」；但主觀上，臺美中三方領導人都不願見到這個情況發生。因為第一，川普政府內部雖瀰漫「反中親臺」氣氛，但美國長期以來主張兩岸「分而不獨，和而不統」的政策沒有改變。川普爭取連任，不希望兩岸任何一方改變現狀，兩岸「地動山搖」不符合美國的利益。
第二，從現在到2022年的中共「二十大」，是習近平眼中的「歷史交匯期」，解決臺灣問題不是習的優先考慮。習提出「兩制臺灣方案」和「民主協商」，目的不是立即處理統一問題，而是希望經由談判，把兩岸關係推向統一的進程。
第三，蔡英文在「臺獨」問題上採不挑釁、不冒進立場，但以「守主權、護民主」來凸顯中華民國存在的現實，讓兩岸政治定位成為雙方的一個「未完成答卷」，而非臺灣獨自面對它。
習近平在2018年底臺灣「九合一」選舉後首度發表的涉臺講話中，就已提到「要牢牢掌握兩岸關係的主導權和主動權」。民進黨在今（2020）年初「二合一」選舉的壓倒性勝利，可能出乎中共的預期；但習近平在對臺政策上仍按照自己的議程辦事。蔡當選後，中共持續對臺施壓，但沒有要與民進黨政府攤牌的打算，兩岸也並未出現地動山搖。與此同時，北京把對臺政策的重點，轉向做好對美工作。
北京密切注視臺美實質關係的提升，但只要美國「說的多，做的少」、沒有跨越紅線，北京的反應也僅止於「例行性」的抗議。值得注意的是，北京藉著加強與美國傳統盟友的關係，增強對美談判的籌碼。在亞洲地區，菲律賓、日本、南韓都是實例；另一方面，北京在與美國簽署的貿易協議中做出了讓步，為川普競選連任加分，也讓他不能毫無忌憚地打「臺灣牌」。
新冠肺炎疫情的爆發，影響到中共「歷史交匯期」的對臺政策布局。首先，疫情的一發不可收拾，暴露了中共一黨專政體制的弱點，這是長期存在的問題，但習近平權力的高度集中卻讓問題嚴重化。習的權位不會受到挑戰，但使用權力的合理性會受到質疑，並有可能因此助長「上有政策，下有對策」的地方形式主義和官僚主義作風。
