針對軍艦染疫事件，民眾黨團22日上午5位立委到齊，總召賴香伶、副總召張其祿、幹事長高虹安、立委邱臣遠、蔡壁如委員共同召開「面對系統失靈 別讓基層官兵作替罪羔羊」記者會，呼籲政府在危機處理時，應面對、解決問題，不要只想透過道歉和部分懲處降低輿論熱度，卻未對檢討整個「體系失靈」情況。蔡壁如也呼籲，應找公衛專家組調查團隊，上軍艦把疫情足跡描述出來，真正發現並解決問題。
張其祿強調，不要讓官兵變替罪羔羊，現在都聚焦在磐石艦運作，但指揮中心權責是「事前指揮、事後控管」，現在國防部長嚴德發一肩扛，說是自己核定，但出航前，跟指揮中心關連為何？後者都不需要知道嗎？張表示，國防外交雖有保密需求，但面對疫情過程中，關於國防事務，疫情指揮中心指揮官能不能有效指揮，還是或國防部說了算？
民眾黨團提出5大質疑：
一、2月20日，敦睦艦隊核定並報備同意，當時是疫情爆發初期，國防部對艦隊出航準備，應有風險評估與管理認知。蔡壁如提到，3月26日，民眾黨團向海軍了解敦睦艦隊防疫措施，海軍回覆，上艦前已排除身體不適者，並且帶足口罩、酒精等工具，也成立回報機制，一天3次，絕對做到滴水不漏。賴香伶則批評，就嚴德發提出的4點缺失檢討，可看出此次艦隊防疫措施，根本沒有「防疫如作戰」的整備就出航。
二、航程期間，已有士官人員多人就診、5人有發燒與上呼吸道症狀，國防部有沒有回報疫情指揮中心？從指揮官陳時中這幾日回應可知，顯然指揮中心在疫情爆發前，對海軍防疫情況完全不知情，只負責說明上岸後處置。同時，為何直到事件爆發後，國防部還是無法百分之百配合疫情中心？
三、國防部確實犯錯，但國防部與疫情指揮中心間的協調指揮，出現系統性問題。張其祿指，基層官兵奉命行事，是受害者。民眾黨團希望政府能盡速彌補此一防疫缺口，而中央疫情指揮中心與國防部之間的問題仍應被好好檢討，國防部應在防疫上全盤接受疫情指揮中心指揮，也應組公衛專業團隊調查。
四、4月18日事件爆發，根據嚴德發說法，現在艦上人員在隔離不能訪查，船艦也在消毒中，無法上艦拿回官兵整理不清楚的就醫資料。黨團質疑，艦上情況不清楚，就醫記錄尚沒辦法整理給岸上的防疫人員，怎麼有辦法在不清不楚情況下召開記者會？
五、3艘艦中僅有1艘出現染病狀況，是否因為有去其它地方，另2艘為何都沒有？蔡壁如也提到，其中有3人已有抗體，依潛伏期加發病期，很可能在上船前已經感染。蔡壁如質疑，依照大陸、歐美、甚至寶瓶星號返台的標準，有居家檢疫或居家隔離，為何這些軍艦返國卻沒有？
民眾黨團強調，既然疫情指揮中心層級已經提升，要充分授權指揮官陳時中，否則就會產生指揮官指揮不了若干單位和部會的事，先前民眾黨也提出相關疑慮。民眾黨團強調，國防部確實犯錯，但防疫體系出現的系統性的問題沒有解決，除了國防部高層要負絕對責任，但不該讓基層官兵遭到獵巫，甚至成為代罪羔羊。
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