中央流行疫情指揮中心成為超強指揮艇，除了李登輝培養出來的國安團隊教戰外，陳建仁還曾赴美取經，學得了包括軟硬體、美國第七軍種防疫醫生等運作靈魂。當年負責執行這項重要任務的關鍵人物郭旭崧，接受《新新聞》專訪，透露外界所不知的祕辛。
對抗武漢肺炎（COVID-19）一戰成名的中央流行疫情指揮中心，正式名稱為國家衛生指揮中心（National Health Command Center, NHCC）。這個指揮中心於二○○三年在如今疾管署地下室成立，當時前總統李登輝培養出來的國安團隊曾祕密進駐，協助建立決策迴路。
後來指揮中心變得超強，有一段外界所不知道的祕辛，即我國曾為此到美國取經，學得了包括軟硬體設計、人力配置等決策靈魂，甚至引進美國第七軍種，建立了如今台灣防疫的關鍵戰力──防疫醫師制度。
郭旭崧陪陳建仁，見美國衛生部長
目前為陽明大學校長，曾擔任我國疾管局局長、署長的郭旭崧，就是當年台灣負責到美國取經的關鍵人物。郭旭崧接受《新新聞》專訪，透露了台美交往這罕為人知的一段。
二○○三年，國安會副秘書長張榮豐等人祕密進駐協助建構指揮中心後，○三年後期，郭旭崧陪當時衛生署長陳建仁去美國，見了時任美國衛生部長湯普森（Tommy George Thompson）。
郭旭崧說，湯普森那時非常驕傲地帶他們去部長辦公室旁邊的ＳＣＣ（Secretary's Command Center）參觀。湯普森對陳建仁和郭旭崧講，○一年發生九一一恐攻及受到炭疽熱攻擊，他發現自己雖然貴為部長，但是疾病管制中心（ＣＤＣ）在亞特蘭大、食品藥品監督管理局（ＦＤＡ）於馬里蘭，他光是要跟他們溝通都很困難，於是就模仿白宮戰情室，蓋了ＳＣＣ。
才經歷台灣ＳＡＲＳ浩劫的陳建仁和郭旭崧在ＳＣＣ受到震撼，又想到ＳＡＲＳ初期那個什麼都沒有的地下室指揮所，當場決定：「這就是我們要的！」
防疫超級戰情室，砸一億重金打造
陳建仁回國之後，在那時的疾管局七樓，花了一億元打造指揮中心，從打牆開始，監工的就是當今疾管署署長周志浩。
由於知道媒體很重要，那時把台灣媒體、甚至全世界媒體訊息的收集都規畫進去，另外還有國會頻道，掌握首長在國會接受質詢的最新狀況；郭旭崧說，那不是要監控媒體，是為了情報蒐集。有一陣子，指揮中心甚至在經過電視台同意後，還可以接收ＳＮＧ車訊號，以取得電視台最新的疫情資訊。
郭旭崧説，電視牆容易做，更重要的人力，怎麼運用？他表示，這部分也依照美國經驗，平常沒事不是空在那裡，要有最低人力配置，疫情開始時，再從別的地方調進來。
